Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYI0

PSD3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSD3Q9NYI0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PSD3Q9NYI0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PSD3Q9NYI0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PSD3Q9NYI0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PSD3Q9NYI0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PSD3Q9NYI0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PSD3Q9NYI0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PSD3Q9NYI0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PSD3Q9NYI0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PSD3Q9NYI0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PSD3Q9NYI0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PSD3Q9NYI0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PSD3Q9NYI0 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PSD3Q9NYI0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
PSD3Q9NYI0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PSD3Q9NYI0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PSD3Q9NYI0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PSD3Q9NYI0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PSD3Q9NYI0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PSD3Q9NYI0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PSD3Q9NYI0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PSD3Q9NYI0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PSD3Q9NYI0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PSD3Q9NYI0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PSD3Q9NYI0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PSD3Q9NYI0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PSD3Q9NYI0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PSD3Q9NYI0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PSD3Q9NYI0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PSD3Q9NYI0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PSD3Q9NYI0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PSD3Q9NYI0 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PSD3Q9NYI0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PSD3Q9NYI0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PSD3Q9NYI0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PSD3Q9NYI0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PSD3Q9NYI0 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PSD3Q9NYI0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PSD3Q9NYI0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PSD3Q9NYI0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PSD3Q9NYI0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PSD3Q9NYI0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PSD3Q9NYI0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PSD3Q9NYI0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PSD3Q9NYI0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PSD3Q9NYI0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PSD3Q9NYI0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PSD3Q9NYI0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PSD3Q9NYI0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PSD3Q9NYI0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PSD3Q9NYI0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PSD3Q9NYI0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PSD3Q9NYI0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PSD3Q9NYI0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PSD3Q9NYI0 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PSD3Q9NYI0 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PSD3Q9NYI0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PSD3Q9NYI0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PSD3Q9NYI0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PSD3Q9NYI0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PSD3Q9NYI0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PSD3Q9NYI0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PSD3Q9NYI0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PSD3Q9NYI0 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PSD3Q9NYI0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PSD3Q9NYI0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PSD3Q9NYI0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PSD3Q9NYI0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PSD3Q9NYI0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PSD3Q9NYI0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PSD3Q9NYI0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PSD3Q9NYI0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PSD3Q9NYI0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PSD3Q9NYI0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PSD3Q9NYI0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PSD3Q9NYI0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PSD3Q9NYI0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PSD3Q9NYI0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
PSD3Q9NYI0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PSD3Q9NYI0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PSD3Q9NYI0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PSD3Q9NYI0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PSD3Q9NYI0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PSD3Q9NYI0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PSD3Q9NYI0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PSD3Q9NYI0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PSD3Q9NYI0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PSD3Q9NYI0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PSD3Q9NYI0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PSD3Q9NYI0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PSD3Q9NYI0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PSD3Q9NYI0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PSD3Q9NYI0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PSD3Q9NYI0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PSD3Q9NYI0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PSD3Q9NYI0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PSD3Q9NYI0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PSD3Q9NYI0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PSD3Q9NYI0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PSD3Q9NYI0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms