Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVA1

UQCC1, Ubiquinol-cytochrome-c reductase complex assembly factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UQCC1Q9NVA1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UQCC1Q9NVA1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UQCC1Q9NVA1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UQCC1Q9NVA1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UQCC1Q9NVA1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UQCC1Q9NVA1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UQCC1Q9NVA1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UQCC1Q9NVA1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UQCC1Q9NVA1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UQCC1Q9NVA1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UQCC1Q9NVA1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UQCC1Q9NVA1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UQCC1Q9NVA1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UQCC1Q9NVA1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UQCC1Q9NVA1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
UQCC1Q9NVA1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UQCC1Q9NVA1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UQCC1Q9NVA1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
UQCC1Q9NVA1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UQCC1Q9NVA1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UQCC1Q9NVA1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UQCC1Q9NVA1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UQCC1Q9NVA1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UQCC1Q9NVA1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
UQCC1Q9NVA1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UQCC1Q9NVA1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UQCC1Q9NVA1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UQCC1Q9NVA1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UQCC1Q9NVA1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UQCC1Q9NVA1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UQCC1Q9NVA1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UQCC1Q9NVA1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UQCC1Q9NVA1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UQCC1Q9NVA1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
UQCC1Q9NVA1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
UQCC1Q9NVA1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UQCC1Q9NVA1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UQCC1Q9NVA1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UQCC1Q9NVA1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UQCC1Q9NVA1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UQCC1Q9NVA1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UQCC1Q9NVA1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UQCC1Q9NVA1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UQCC1Q9NVA1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UQCC1Q9NVA1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UQCC1Q9NVA1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UQCC1Q9NVA1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UQCC1Q9NVA1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UQCC1Q9NVA1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UQCC1Q9NVA1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UQCC1Q9NVA1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UQCC1Q9NVA1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UQCC1Q9NVA1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UQCC1Q9NVA1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UQCC1Q9NVA1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UQCC1Q9NVA1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UQCC1Q9NVA1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UQCC1Q9NVA1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UQCC1Q9NVA1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UQCC1Q9NVA1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UQCC1Q9NVA1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UQCC1Q9NVA1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UQCC1Q9NVA1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UQCC1Q9NVA1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UQCC1Q9NVA1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UQCC1Q9NVA1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UQCC1Q9NVA1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UQCC1Q9NVA1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UQCC1Q9NVA1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UQCC1Q9NVA1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UQCC1Q9NVA1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UQCC1Q9NVA1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UQCC1Q9NVA1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UQCC1Q9NVA1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UQCC1Q9NVA1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UQCC1Q9NVA1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UQCC1Q9NVA1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
UQCC1Q9NVA1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UQCC1Q9NVA1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UQCC1Q9NVA1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UQCC1Q9NVA1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UQCC1Q9NVA1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UQCC1Q9NVA1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UQCC1Q9NVA1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UQCC1Q9NVA1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UQCC1Q9NVA1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UQCC1Q9NVA1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UQCC1Q9NVA1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UQCC1Q9NVA1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UQCC1Q9NVA1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UQCC1Q9NVA1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UQCC1Q9NVA1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UQCC1Q9NVA1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UQCC1Q9NVA1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UQCC1Q9NVA1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UQCC1Q9NVA1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UQCC1Q9NVA1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UQCC1Q9NVA1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UQCC1Q9NVA1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UQCC1Q9NVA1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms