Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR23

GDF3, Growth/differentiation factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF3Q9NR23 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GDF3Q9NR23 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GDF3Q9NR23 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GDF3Q9NR23 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GDF3Q9NR23 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GDF3Q9NR23 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GDF3Q9NR23 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GDF3Q9NR23 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GDF3Q9NR23 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GDF3Q9NR23 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GDF3Q9NR23 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GDF3Q9NR23 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GDF3Q9NR23 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GDF3Q9NR23 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GDF3Q9NR23 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GDF3Q9NR23 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GDF3Q9NR23 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GDF3Q9NR23 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
GDF3Q9NR23 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GDF3Q9NR23 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GDF3Q9NR23 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GDF3Q9NR23 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GDF3Q9NR23 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GDF3Q9NR23 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GDF3Q9NR23 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GDF3Q9NR23 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GDF3Q9NR23 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GDF3Q9NR23 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
GDF3Q9NR23 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GDF3Q9NR23 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GDF3Q9NR23 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GDF3Q9NR23 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GDF3Q9NR23 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GDF3Q9NR23 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GDF3Q9NR23 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GDF3Q9NR23 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GDF3Q9NR23 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GDF3Q9NR23 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GDF3Q9NR23 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GDF3Q9NR23 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GDF3Q9NR23 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GDF3Q9NR23 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GDF3Q9NR23 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GDF3Q9NR23 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GDF3Q9NR23 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GDF3Q9NR23 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GDF3Q9NR23 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GDF3Q9NR23 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GDF3Q9NR23 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GDF3Q9NR23 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GDF3Q9NR23 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GDF3Q9NR23 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GDF3Q9NR23 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
GDF3Q9NR23 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GDF3Q9NR23 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
GDF3Q9NR23 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GDF3Q9NR23 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GDF3Q9NR23 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GDF3Q9NR23 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GDF3Q9NR23 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GDF3Q9NR23 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GDF3Q9NR23 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GDF3Q9NR23 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GDF3Q9NR23 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GDF3Q9NR23 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GDF3Q9NR23 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GDF3Q9NR23 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GDF3Q9NR23 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GDF3Q9NR23 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GDF3Q9NR23 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GDF3Q9NR23 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GDF3Q9NR23 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GDF3Q9NR23 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GDF3Q9NR23 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GDF3Q9NR23 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
GDF3Q9NR23 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GDF3Q9NR23 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GDF3Q9NR23 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GDF3Q9NR23 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GDF3Q9NR23 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GDF3Q9NR23 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GDF3Q9NR23 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GDF3Q9NR23 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
GDF3Q9NR23 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GDF3Q9NR23 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GDF3Q9NR23 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GDF3Q9NR23 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GDF3Q9NR23 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GDF3Q9NR23 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GDF3Q9NR23 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
GDF3Q9NR23 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GDF3Q9NR23 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GDF3Q9NR23 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GDF3Q9NR23 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GDF3Q9NR23 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GDF3Q9NR23 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GDF3Q9NR23 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GDF3Q9NR23 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
GDF3Q9NR23 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GDF3Q9NR23 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms