Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ89

C12orf4, Protein C12orf4, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf4Q9NQ89 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C12orf4Q9NQ89 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C12orf4Q9NQ89 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C12orf4Q9NQ89 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C12orf4Q9NQ89 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C12orf4Q9NQ89 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C12orf4Q9NQ89 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C12orf4Q9NQ89 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C12orf4Q9NQ89 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C12orf4Q9NQ89 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
C12orf4Q9NQ89 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C12orf4Q9NQ89 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C12orf4Q9NQ89 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C12orf4Q9NQ89 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C12orf4Q9NQ89 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C12orf4Q9NQ89 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C12orf4Q9NQ89 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C12orf4Q9NQ89 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C12orf4Q9NQ89 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C12orf4Q9NQ89 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C12orf4Q9NQ89 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C12orf4Q9NQ89 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C12orf4Q9NQ89 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C12orf4Q9NQ89 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C12orf4Q9NQ89 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C12orf4Q9NQ89 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C12orf4Q9NQ89 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C12orf4Q9NQ89 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C12orf4Q9NQ89 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C12orf4Q9NQ89 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C12orf4Q9NQ89 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C12orf4Q9NQ89 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C12orf4Q9NQ89 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C12orf4Q9NQ89 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C12orf4Q9NQ89 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C12orf4Q9NQ89 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C12orf4Q9NQ89 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C12orf4Q9NQ89 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C12orf4Q9NQ89 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
C12orf4Q9NQ89 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C12orf4Q9NQ89 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C12orf4Q9NQ89 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C12orf4Q9NQ89 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C12orf4Q9NQ89 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C12orf4Q9NQ89 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C12orf4Q9NQ89 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C12orf4Q9NQ89 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C12orf4Q9NQ89 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C12orf4Q9NQ89 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C12orf4Q9NQ89 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C12orf4Q9NQ89 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C12orf4Q9NQ89 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C12orf4Q9NQ89 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C12orf4Q9NQ89 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C12orf4Q9NQ89 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C12orf4Q9NQ89 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C12orf4Q9NQ89 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C12orf4Q9NQ89 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C12orf4Q9NQ89 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C12orf4Q9NQ89 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C12orf4Q9NQ89 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C12orf4Q9NQ89 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C12orf4Q9NQ89 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C12orf4Q9NQ89 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
C12orf4Q9NQ89 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C12orf4Q9NQ89 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C12orf4Q9NQ89 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C12orf4Q9NQ89 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C12orf4Q9NQ89 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C12orf4Q9NQ89 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C12orf4Q9NQ89 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C12orf4Q9NQ89 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C12orf4Q9NQ89 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C12orf4Q9NQ89 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C12orf4Q9NQ89 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C12orf4Q9NQ89 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C12orf4Q9NQ89 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C12orf4Q9NQ89 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C12orf4Q9NQ89 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C12orf4Q9NQ89 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C12orf4Q9NQ89 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C12orf4Q9NQ89 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C12orf4Q9NQ89 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
C12orf4Q9NQ89 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C12orf4Q9NQ89 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C12orf4Q9NQ89 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C12orf4Q9NQ89 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C12orf4Q9NQ89 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
C12orf4Q9NQ89 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C12orf4Q9NQ89 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C12orf4Q9NQ89 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C12orf4Q9NQ89 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C12orf4Q9NQ89 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C12orf4Q9NQ89 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C12orf4Q9NQ89 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C12orf4Q9NQ89 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
C12orf4Q9NQ89 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
C12orf4Q9NQ89 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
C12orf4Q9NQ89 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C12orf4Q9NQ89 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms