Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K3

ACTR3C, Actin-related protein 3C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3CQ9C0K3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTR3CQ9C0K3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTR3CQ9C0K3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTR3CQ9C0K3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTR3CQ9C0K3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTR3CQ9C0K3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTR3CQ9C0K3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTR3CQ9C0K3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTR3CQ9C0K3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ACTR3CQ9C0K3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTR3CQ9C0K3 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTR3CQ9C0K3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTR3CQ9C0K3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTR3CQ9C0K3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTR3CQ9C0K3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTR3CQ9C0K3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTR3CQ9C0K3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTR3CQ9C0K3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTR3CQ9C0K3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTR3CQ9C0K3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTR3CQ9C0K3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTR3CQ9C0K3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTR3CQ9C0K3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTR3CQ9C0K3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTR3CQ9C0K3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTR3CQ9C0K3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTR3CQ9C0K3 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTR3CQ9C0K3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTR3CQ9C0K3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ACTR3CQ9C0K3 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTR3CQ9C0K3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTR3CQ9C0K3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTR3CQ9C0K3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTR3CQ9C0K3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTR3CQ9C0K3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTR3CQ9C0K3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTR3CQ9C0K3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTR3CQ9C0K3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTR3CQ9C0K3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTR3CQ9C0K3 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTR3CQ9C0K3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTR3CQ9C0K3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTR3CQ9C0K3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACTR3CQ9C0K3 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACTR3CQ9C0K3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ACTR3CQ9C0K3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACTR3CQ9C0K3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ACTR3CQ9C0K3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACTR3CQ9C0K3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACTR3CQ9C0K3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACTR3CQ9C0K3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACTR3CQ9C0K3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACTR3CQ9C0K3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACTR3CQ9C0K3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACTR3CQ9C0K3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACTR3CQ9C0K3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACTR3CQ9C0K3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACTR3CQ9C0K3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTR3CQ9C0K3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTR3CQ9C0K3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTR3CQ9C0K3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTR3CQ9C0K3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTR3CQ9C0K3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTR3CQ9C0K3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTR3CQ9C0K3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTR3CQ9C0K3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTR3CQ9C0K3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTR3CQ9C0K3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTR3CQ9C0K3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTR3CQ9C0K3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTR3CQ9C0K3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTR3CQ9C0K3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTR3CQ9C0K3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTR3CQ9C0K3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTR3CQ9C0K3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTR3CQ9C0K3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTR3CQ9C0K3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTR3CQ9C0K3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTR3CQ9C0K3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACTR3CQ9C0K3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACTR3CQ9C0K3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACTR3CQ9C0K3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACTR3CQ9C0K3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACTR3CQ9C0K3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACTR3CQ9C0K3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACTR3CQ9C0K3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACTR3CQ9C0K3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTR3CQ9C0K3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTR3CQ9C0K3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTR3CQ9C0K3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTR3CQ9C0K3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTR3CQ9C0K3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACTR3CQ9C0K3 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACTR3CQ9C0K3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACTR3CQ9C0K3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACTR3CQ9C0K3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTR3CQ9C0K3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTR3CQ9C0K3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTR3CQ9C0K3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTR3CQ9C0K3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms