Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D2

CEP295, Centrosomal protein of 295 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP295Q9C0D2 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CEP295Q9C0D2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CEP295Q9C0D2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CEP295Q9C0D2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CEP295Q9C0D2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CEP295Q9C0D2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CEP295Q9C0D2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CEP295Q9C0D2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CEP295Q9C0D2 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CEP295Q9C0D2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CEP295Q9C0D2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CEP295Q9C0D2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CEP295Q9C0D2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CEP295Q9C0D2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CEP295Q9C0D2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CEP295Q9C0D2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CEP295Q9C0D2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CEP295Q9C0D2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CEP295Q9C0D2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CEP295Q9C0D2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CEP295Q9C0D2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CEP295Q9C0D2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CEP295Q9C0D2 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CEP295Q9C0D2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CEP295Q9C0D2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CEP295Q9C0D2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CEP295Q9C0D2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CEP295Q9C0D2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CEP295Q9C0D2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CEP295Q9C0D2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CEP295Q9C0D2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CEP295Q9C0D2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CEP295Q9C0D2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CEP295Q9C0D2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CEP295Q9C0D2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CEP295Q9C0D2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CEP295Q9C0D2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CEP295Q9C0D2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CEP295Q9C0D2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CEP295Q9C0D2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CEP295Q9C0D2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CEP295Q9C0D2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CEP295Q9C0D2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CEP295Q9C0D2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CEP295Q9C0D2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CEP295Q9C0D2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CEP295Q9C0D2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CEP295Q9C0D2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CEP295Q9C0D2 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CEP295Q9C0D2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CEP295Q9C0D2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CEP295Q9C0D2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CEP295Q9C0D2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CEP295Q9C0D2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CEP295Q9C0D2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CEP295Q9C0D2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CEP295Q9C0D2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CEP295Q9C0D2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CEP295Q9C0D2 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CEP295Q9C0D2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CEP295Q9C0D2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CEP295Q9C0D2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CEP295Q9C0D2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CEP295Q9C0D2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CEP295Q9C0D2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CEP295Q9C0D2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CEP295Q9C0D2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CEP295Q9C0D2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CEP295Q9C0D2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CEP295Q9C0D2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CEP295Q9C0D2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CEP295Q9C0D2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CEP295Q9C0D2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CEP295Q9C0D2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CEP295Q9C0D2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CEP295Q9C0D2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CEP295Q9C0D2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CEP295Q9C0D2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CEP295Q9C0D2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CEP295Q9C0D2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CEP295Q9C0D2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CEP295Q9C0D2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CEP295Q9C0D2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CEP295Q9C0D2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CEP295Q9C0D2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CEP295Q9C0D2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CEP295Q9C0D2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CEP295Q9C0D2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CEP295Q9C0D2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CEP295Q9C0D2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CEP295Q9C0D2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CEP295Q9C0D2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CEP295Q9C0D2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CEP295Q9C0D2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CEP295Q9C0D2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CEP295Q9C0D2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CEP295Q9C0D2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CEP295Q9C0D2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CEP295Q9C0D2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CEP295Q9C0D2 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms