Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ROPN1BQ9BZX4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ROPN1BQ9BZX4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ROPN1BQ9BZX4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ROPN1BQ9BZX4 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ROPN1BQ9BZX4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ROPN1BQ9BZX4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ROPN1BQ9BZX4 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ROPN1BQ9BZX4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ROPN1BQ9BZX4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ROPN1BQ9BZX4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ROPN1BQ9BZX4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ROPN1BQ9BZX4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ROPN1BQ9BZX4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ROPN1BQ9BZX4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ROPN1BQ9BZX4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ROPN1BQ9BZX4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
ROPN1BQ9BZX4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ROPN1BQ9BZX4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ROPN1BQ9BZX4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ROPN1BQ9BZX4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ROPN1BQ9BZX4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ROPN1BQ9BZX4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ROPN1BQ9BZX4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ROPN1BQ9BZX4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ROPN1BQ9BZX4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ROPN1BQ9BZX4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
ROPN1BQ9BZX4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ROPN1BQ9BZX4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ROPN1BQ9BZX4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ROPN1BQ9BZX4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ROPN1BQ9BZX4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ROPN1BQ9BZX4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ROPN1BQ9BZX4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ROPN1BQ9BZX4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ROPN1BQ9BZX4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ROPN1BQ9BZX4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ROPN1BQ9BZX4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ROPN1BQ9BZX4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ROPN1BQ9BZX4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ROPN1BQ9BZX4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ROPN1BQ9BZX4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ROPN1BQ9BZX4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
ROPN1BQ9BZX4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ROPN1BQ9BZX4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ROPN1BQ9BZX4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ROPN1BQ9BZX4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ROPN1BQ9BZX4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ROPN1BQ9BZX4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ROPN1BQ9BZX4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ROPN1BQ9BZX4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ROPN1BQ9BZX4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ROPN1BQ9BZX4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
ROPN1BQ9BZX4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ROPN1BQ9BZX4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ROPN1BQ9BZX4 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ROPN1BQ9BZX4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ROPN1BQ9BZX4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ROPN1BQ9BZX4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ROPN1BQ9BZX4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ROPN1BQ9BZX4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ROPN1BQ9BZX4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ROPN1BQ9BZX4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ROPN1BQ9BZX4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ROPN1BQ9BZX4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ROPN1BQ9BZX4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ROPN1BQ9BZX4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ROPN1BQ9BZX4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ROPN1BQ9BZX4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ROPN1BQ9BZX4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ROPN1BQ9BZX4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ROPN1BQ9BZX4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ROPN1BQ9BZX4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ROPN1BQ9BZX4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ROPN1BQ9BZX4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ROPN1BQ9BZX4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ROPN1BQ9BZX4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ROPN1BQ9BZX4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ROPN1BQ9BZX4 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ROPN1BQ9BZX4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ROPN1BQ9BZX4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ROPN1BQ9BZX4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ROPN1BQ9BZX4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ROPN1BQ9BZX4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ROPN1BQ9BZX4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ROPN1BQ9BZX4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ROPN1BQ9BZX4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ROPN1BQ9BZX4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ROPN1BQ9BZX4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
ROPN1BQ9BZX4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ROPN1BQ9BZX4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ROPN1BQ9BZX4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ROPN1BQ9BZX4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ROPN1BQ9BZX4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ROPN1BQ9BZX4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ROPN1BQ9BZX4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ROPN1BQ9BZX4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ROPN1BQ9BZX4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ROPN1BQ9BZX4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ROPN1BQ9BZX4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms