Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM3Q9BZL3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMIM3Q9BZL3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMIM3Q9BZL3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM3Q9BZL3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM3Q9BZL3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM3Q9BZL3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM3Q9BZL3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMIM3Q9BZL3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMIM3Q9BZL3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM3Q9BZL3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM3Q9BZL3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMIM3Q9BZL3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMIM3Q9BZL3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMIM3Q9BZL3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMIM3Q9BZL3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMIM3Q9BZL3 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMIM3Q9BZL3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMIM3Q9BZL3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMIM3Q9BZL3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMIM3Q9BZL3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMIM3Q9BZL3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMIM3Q9BZL3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMIM3Q9BZL3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMIM3Q9BZL3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMIM3Q9BZL3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMIM3Q9BZL3 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMIM3Q9BZL3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMIM3Q9BZL3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMIM3Q9BZL3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMIM3Q9BZL3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMIM3Q9BZL3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMIM3Q9BZL3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMIM3Q9BZL3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMIM3Q9BZL3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMIM3Q9BZL3 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMIM3Q9BZL3 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMIM3Q9BZL3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMIM3Q9BZL3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMIM3Q9BZL3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMIM3Q9BZL3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMIM3Q9BZL3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMIM3Q9BZL3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMIM3Q9BZL3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMIM3Q9BZL3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMIM3Q9BZL3 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMIM3Q9BZL3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMIM3Q9BZL3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMIM3Q9BZL3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMIM3Q9BZL3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMIM3Q9BZL3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMIM3Q9BZL3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMIM3Q9BZL3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMIM3Q9BZL3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMIM3Q9BZL3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMIM3Q9BZL3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMIM3Q9BZL3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMIM3Q9BZL3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMIM3Q9BZL3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMIM3Q9BZL3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMIM3Q9BZL3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMIM3Q9BZL3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMIM3Q9BZL3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMIM3Q9BZL3 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMIM3Q9BZL3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMIM3Q9BZL3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMIM3Q9BZL3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMIM3Q9BZL3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMIM3Q9BZL3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMIM3Q9BZL3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMIM3Q9BZL3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMIM3Q9BZL3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMIM3Q9BZL3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMIM3Q9BZL3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SMIM3Q9BZL3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMIM3Q9BZL3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMIM3Q9BZL3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMIM3Q9BZL3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMIM3Q9BZL3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SMIM3Q9BZL3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMIM3Q9BZL3 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMIM3Q9BZL3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMIM3Q9BZL3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMIM3Q9BZL3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMIM3Q9BZL3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMIM3Q9BZL3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMIM3Q9BZL3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMIM3Q9BZL3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMIM3Q9BZL3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMIM3Q9BZL3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMIM3Q9BZL3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMIM3Q9BZL3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMIM3Q9BZL3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMIM3Q9BZL3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMIM3Q9BZL3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMIM3Q9BZL3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMIM3Q9BZL3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMIM3Q9BZL3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMIM3Q9BZL3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMIM3Q9BZL3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms