Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MAP1LC3CQ9BXW4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms