Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSBP4Q9BWG4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSBP4Q9BWG4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSBP4Q9BWG4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSBP4Q9BWG4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSBP4Q9BWG4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSBP4Q9BWG4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSBP4Q9BWG4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSBP4Q9BWG4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSBP4Q9BWG4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSBP4Q9BWG4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SSBP4Q9BWG4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SSBP4Q9BWG4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SSBP4Q9BWG4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SSBP4Q9BWG4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SSBP4Q9BWG4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SSBP4Q9BWG4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SSBP4Q9BWG4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSBP4Q9BWG4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSBP4Q9BWG4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSBP4Q9BWG4 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSBP4Q9BWG4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSBP4Q9BWG4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSBP4Q9BWG4 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSBP4Q9BWG4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSBP4Q9BWG4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSBP4Q9BWG4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSBP4Q9BWG4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSBP4Q9BWG4 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSBP4Q9BWG4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSBP4Q9BWG4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSBP4Q9BWG4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSBP4Q9BWG4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSBP4Q9BWG4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSBP4Q9BWG4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSBP4Q9BWG4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSBP4Q9BWG4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSBP4Q9BWG4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSBP4Q9BWG4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSBP4Q9BWG4 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSBP4Q9BWG4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSBP4Q9BWG4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSBP4Q9BWG4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSBP4Q9BWG4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSBP4Q9BWG4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSBP4Q9BWG4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSBP4Q9BWG4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSBP4Q9BWG4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSBP4Q9BWG4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSBP4Q9BWG4 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSBP4Q9BWG4 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSBP4Q9BWG4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSBP4Q9BWG4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSBP4Q9BWG4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSBP4Q9BWG4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSBP4Q9BWG4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSBP4Q9BWG4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSBP4Q9BWG4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSBP4Q9BWG4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSBP4Q9BWG4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSBP4Q9BWG4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSBP4Q9BWG4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSBP4Q9BWG4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSBP4Q9BWG4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSBP4Q9BWG4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSBP4Q9BWG4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSBP4Q9BWG4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSBP4Q9BWG4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSBP4Q9BWG4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSBP4Q9BWG4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSBP4Q9BWG4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSBP4Q9BWG4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSBP4Q9BWG4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSBP4Q9BWG4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SSBP4Q9BWG4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SSBP4Q9BWG4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSBP4Q9BWG4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSBP4Q9BWG4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SSBP4Q9BWG4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SSBP4Q9BWG4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SSBP4Q9BWG4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSBP4Q9BWG4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSBP4Q9BWG4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSBP4Q9BWG4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSBP4Q9BWG4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSBP4Q9BWG4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SSBP4Q9BWG4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SSBP4Q9BWG4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SSBP4Q9BWG4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SSBP4Q9BWG4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SSBP4Q9BWG4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SSBP4Q9BWG4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSBP4Q9BWG4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSBP4Q9BWG4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSBP4Q9BWG4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSBP4Q9BWG4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSBP4Q9BWG4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SSBP4Q9BWG4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SSBP4Q9BWG4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SSBP4Q9BWG4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms