Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVW6

SMIM2, Small integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM2Q9BVW6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SMIM2Q9BVW6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMIM2Q9BVW6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMIM2Q9BVW6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMIM2Q9BVW6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMIM2Q9BVW6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMIM2Q9BVW6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMIM2Q9BVW6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMIM2Q9BVW6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMIM2Q9BVW6 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMIM2Q9BVW6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMIM2Q9BVW6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMIM2Q9BVW6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMIM2Q9BVW6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMIM2Q9BVW6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMIM2Q9BVW6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMIM2Q9BVW6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMIM2Q9BVW6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMIM2Q9BVW6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SMIM2Q9BVW6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SMIM2Q9BVW6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMIM2Q9BVW6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMIM2Q9BVW6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMIM2Q9BVW6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMIM2Q9BVW6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMIM2Q9BVW6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMIM2Q9BVW6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMIM2Q9BVW6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMIM2Q9BVW6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMIM2Q9BVW6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
SMIM2Q9BVW6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SMIM2Q9BVW6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SMIM2Q9BVW6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMIM2Q9BVW6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMIM2Q9BVW6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMIM2Q9BVW6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMIM2Q9BVW6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMIM2Q9BVW6 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMIM2Q9BVW6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMIM2Q9BVW6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMIM2Q9BVW6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SMIM2Q9BVW6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SMIM2Q9BVW6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMIM2Q9BVW6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMIM2Q9BVW6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMIM2Q9BVW6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SMIM2Q9BVW6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMIM2Q9BVW6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMIM2Q9BVW6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMIM2Q9BVW6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMIM2Q9BVW6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMIM2Q9BVW6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMIM2Q9BVW6 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMIM2Q9BVW6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMIM2Q9BVW6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMIM2Q9BVW6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMIM2Q9BVW6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMIM2Q9BVW6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SMIM2Q9BVW6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMIM2Q9BVW6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMIM2Q9BVW6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMIM2Q9BVW6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMIM2Q9BVW6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMIM2Q9BVW6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMIM2Q9BVW6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMIM2Q9BVW6 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMIM2Q9BVW6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMIM2Q9BVW6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMIM2Q9BVW6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMIM2Q9BVW6 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMIM2Q9BVW6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMIM2Q9BVW6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMIM2Q9BVW6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMIM2Q9BVW6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMIM2Q9BVW6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMIM2Q9BVW6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMIM2Q9BVW6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMIM2Q9BVW6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMIM2Q9BVW6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMIM2Q9BVW6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMIM2Q9BVW6 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMIM2Q9BVW6 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMIM2Q9BVW6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMIM2Q9BVW6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMIM2Q9BVW6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMIM2Q9BVW6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMIM2Q9BVW6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMIM2Q9BVW6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMIM2Q9BVW6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMIM2Q9BVW6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SMIM2Q9BVW6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMIM2Q9BVW6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMIM2Q9BVW6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMIM2Q9BVW6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMIM2Q9BVW6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMIM2Q9BVW6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMIM2Q9BVW6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMIM2Q9BVW6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SMIM2Q9BVW6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMIM2Q9BVW6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms