Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU61

NDUFAF3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF3Q9BU61 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NDUFAF3Q9BU61 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NDUFAF3Q9BU61 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NDUFAF3Q9BU61 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NDUFAF3Q9BU61 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NDUFAF3Q9BU61 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NDUFAF3Q9BU61 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NDUFAF3Q9BU61 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NDUFAF3Q9BU61 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NDUFAF3Q9BU61 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NDUFAF3Q9BU61 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NDUFAF3Q9BU61 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NDUFAF3Q9BU61 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NDUFAF3Q9BU61 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NDUFAF3Q9BU61 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NDUFAF3Q9BU61 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NDUFAF3Q9BU61 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
NDUFAF3Q9BU61 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NDUFAF3Q9BU61 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NDUFAF3Q9BU61 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NDUFAF3Q9BU61 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NDUFAF3Q9BU61 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NDUFAF3Q9BU61 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NDUFAF3Q9BU61 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NDUFAF3Q9BU61 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NDUFAF3Q9BU61 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NDUFAF3Q9BU61 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NDUFAF3Q9BU61 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NDUFAF3Q9BU61 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NDUFAF3Q9BU61 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NDUFAF3Q9BU61 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NDUFAF3Q9BU61 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NDUFAF3Q9BU61 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NDUFAF3Q9BU61 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NDUFAF3Q9BU61 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NDUFAF3Q9BU61 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NDUFAF3Q9BU61 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NDUFAF3Q9BU61 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NDUFAF3Q9BU61 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NDUFAF3Q9BU61 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NDUFAF3Q9BU61 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NDUFAF3Q9BU61 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NDUFAF3Q9BU61 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NDUFAF3Q9BU61 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NDUFAF3Q9BU61 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NDUFAF3Q9BU61 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NDUFAF3Q9BU61 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NDUFAF3Q9BU61 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NDUFAF3Q9BU61 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NDUFAF3Q9BU61 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NDUFAF3Q9BU61 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NDUFAF3Q9BU61 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NDUFAF3Q9BU61 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NDUFAF3Q9BU61 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NDUFAF3Q9BU61 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NDUFAF3Q9BU61 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NDUFAF3Q9BU61 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NDUFAF3Q9BU61 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NDUFAF3Q9BU61 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NDUFAF3Q9BU61 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NDUFAF3Q9BU61 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NDUFAF3Q9BU61 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NDUFAF3Q9BU61 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NDUFAF3Q9BU61 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NDUFAF3Q9BU61 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NDUFAF3Q9BU61 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NDUFAF3Q9BU61 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NDUFAF3Q9BU61 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NDUFAF3Q9BU61 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NDUFAF3Q9BU61 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NDUFAF3Q9BU61 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NDUFAF3Q9BU61 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NDUFAF3Q9BU61 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NDUFAF3Q9BU61 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NDUFAF3Q9BU61 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NDUFAF3Q9BU61 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NDUFAF3Q9BU61 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NDUFAF3Q9BU61 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NDUFAF3Q9BU61 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NDUFAF3Q9BU61 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NDUFAF3Q9BU61 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NDUFAF3Q9BU61 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NDUFAF3Q9BU61 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NDUFAF3Q9BU61 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NDUFAF3Q9BU61 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NDUFAF3Q9BU61 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NDUFAF3Q9BU61 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NDUFAF3Q9BU61 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NDUFAF3Q9BU61 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NDUFAF3Q9BU61 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NDUFAF3Q9BU61 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NDUFAF3Q9BU61 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NDUFAF3Q9BU61 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NDUFAF3Q9BU61 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NDUFAF3Q9BU61 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NDUFAF3Q9BU61 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NDUFAF3Q9BU61 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NDUFAF3Q9BU61 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NDUFAF3Q9BU61 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NDUFAF3Q9BU61 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms