Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C2orf88Q9BSF0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C2orf88Q9BSF0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C2orf88Q9BSF0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C2orf88Q9BSF0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C2orf88Q9BSF0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C2orf88Q9BSF0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C2orf88Q9BSF0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C2orf88Q9BSF0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C2orf88Q9BSF0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C2orf88Q9BSF0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C2orf88Q9BSF0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C2orf88Q9BSF0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C2orf88Q9BSF0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C2orf88Q9BSF0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C2orf88Q9BSF0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C2orf88Q9BSF0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C2orf88Q9BSF0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C2orf88Q9BSF0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C2orf88Q9BSF0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C2orf88Q9BSF0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C2orf88Q9BSF0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C2orf88Q9BSF0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C2orf88Q9BSF0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C2orf88Q9BSF0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C2orf88Q9BSF0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C2orf88Q9BSF0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C2orf88Q9BSF0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C2orf88Q9BSF0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C2orf88Q9BSF0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C2orf88Q9BSF0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C2orf88Q9BSF0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C2orf88Q9BSF0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C2orf88Q9BSF0 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C2orf88Q9BSF0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C2orf88Q9BSF0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C2orf88Q9BSF0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C2orf88Q9BSF0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C2orf88Q9BSF0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C2orf88Q9BSF0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C2orf88Q9BSF0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C2orf88Q9BSF0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
C2orf88Q9BSF0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C2orf88Q9BSF0 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C2orf88Q9BSF0 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C2orf88Q9BSF0 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C2orf88Q9BSF0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C2orf88Q9BSF0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C2orf88Q9BSF0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C2orf88Q9BSF0 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C2orf88Q9BSF0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C2orf88Q9BSF0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C2orf88Q9BSF0 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C2orf88Q9BSF0 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C2orf88Q9BSF0 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C2orf88Q9BSF0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C2orf88Q9BSF0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C2orf88Q9BSF0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C2orf88Q9BSF0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C2orf88Q9BSF0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C2orf88Q9BSF0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C2orf88Q9BSF0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C2orf88Q9BSF0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C2orf88Q9BSF0 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C2orf88Q9BSF0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C2orf88Q9BSF0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C2orf88Q9BSF0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C2orf88Q9BSF0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C2orf88Q9BSF0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
C2orf88Q9BSF0 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C2orf88Q9BSF0 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
C2orf88Q9BSF0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
C2orf88Q9BSF0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C2orf88Q9BSF0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C2orf88Q9BSF0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C2orf88Q9BSF0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C2orf88Q9BSF0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
C2orf88Q9BSF0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C2orf88Q9BSF0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C2orf88Q9BSF0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C2orf88Q9BSF0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C2orf88Q9BSF0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C2orf88Q9BSF0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C2orf88Q9BSF0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C2orf88Q9BSF0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C2orf88Q9BSF0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C2orf88Q9BSF0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C2orf88Q9BSF0 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
C2orf88Q9BSF0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C2orf88Q9BSF0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
C2orf88Q9BSF0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
C2orf88Q9BSF0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
C2orf88Q9BSF0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
C2orf88Q9BSF0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
C2orf88Q9BSF0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
C2orf88Q9BSF0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
C2orf88Q9BSF0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
C2orf88Q9BSF0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
C2orf88Q9BSF0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
C2orf88Q9BSF0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms