Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNS3Q9BQ31 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNS3Q9BQ31 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNS3Q9BQ31 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNS3Q9BQ31 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNS3Q9BQ31 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNS3Q9BQ31 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNS3Q9BQ31 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNS3Q9BQ31 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNS3Q9BQ31 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNS3Q9BQ31 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
KCNS3Q9BQ31 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNS3Q9BQ31 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNS3Q9BQ31 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNS3Q9BQ31 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNS3Q9BQ31 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNS3Q9BQ31 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNS3Q9BQ31 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNS3Q9BQ31 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNS3Q9BQ31 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNS3Q9BQ31 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNS3Q9BQ31 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNS3Q9BQ31 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNS3Q9BQ31 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNS3Q9BQ31 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNS3Q9BQ31 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNS3Q9BQ31 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNS3Q9BQ31 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNS3Q9BQ31 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNS3Q9BQ31 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNS3Q9BQ31 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNS3Q9BQ31 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNS3Q9BQ31 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNS3Q9BQ31 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNS3Q9BQ31 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNS3Q9BQ31 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNS3Q9BQ31 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNS3Q9BQ31 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNS3Q9BQ31 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNS3Q9BQ31 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNS3Q9BQ31 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KCNS3Q9BQ31 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNS3Q9BQ31 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNS3Q9BQ31 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNS3Q9BQ31 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNS3Q9BQ31 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
KCNS3Q9BQ31 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNS3Q9BQ31 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNS3Q9BQ31 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNS3Q9BQ31 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNS3Q9BQ31 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNS3Q9BQ31 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNS3Q9BQ31 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNS3Q9BQ31 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNS3Q9BQ31 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNS3Q9BQ31 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNS3Q9BQ31 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNS3Q9BQ31 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNS3Q9BQ31 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNS3Q9BQ31 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNS3Q9BQ31 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNS3Q9BQ31 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNS3Q9BQ31 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNS3Q9BQ31 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNS3Q9BQ31 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNS3Q9BQ31 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNS3Q9BQ31 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNS3Q9BQ31 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNS3Q9BQ31 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNS3Q9BQ31 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNS3Q9BQ31 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNS3Q9BQ31 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNS3Q9BQ31 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNS3Q9BQ31 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNS3Q9BQ31 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNS3Q9BQ31 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNS3Q9BQ31 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNS3Q9BQ31 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNS3Q9BQ31 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNS3Q9BQ31 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNS3Q9BQ31 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNS3Q9BQ31 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNS3Q9BQ31 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNS3Q9BQ31 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNS3Q9BQ31 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNS3Q9BQ31 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNS3Q9BQ31 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNS3Q9BQ31 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNS3Q9BQ31 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNS3Q9BQ31 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNS3Q9BQ31 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNS3Q9BQ31 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNS3Q9BQ31 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNS3Q9BQ31 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNS3Q9BQ31 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNS3Q9BQ31 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNS3Q9BQ31 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNS3Q9BQ31 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNS3Q9BQ31 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNS3Q9BQ31 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.7 ms