Protein–RNA interactions for Protein: Q99576

TSC22D3, TSC22 domain family protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC22D3Q99576 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TSC22D3Q99576 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TSC22D3Q99576 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSC22D3Q99576 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSC22D3Q99576 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TSC22D3Q99576 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TSC22D3Q99576 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TSC22D3Q99576 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TSC22D3Q99576 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TSC22D3Q99576 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TSC22D3Q99576 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TSC22D3Q99576 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TSC22D3Q99576 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TSC22D3Q99576 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSC22D3Q99576 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSC22D3Q99576 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSC22D3Q99576 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TSC22D3Q99576 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TSC22D3Q99576 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TSC22D3Q99576 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TSC22D3Q99576 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TSC22D3Q99576 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TSC22D3Q99576 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TSC22D3Q99576 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TSC22D3Q99576 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TSC22D3Q99576 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
TSC22D3Q99576 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TSC22D3Q99576 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TSC22D3Q99576 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TSC22D3Q99576 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TSC22D3Q99576 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TSC22D3Q99576 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TSC22D3Q99576 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TSC22D3Q99576 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSC22D3Q99576 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSC22D3Q99576 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSC22D3Q99576 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSC22D3Q99576 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSC22D3Q99576 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSC22D3Q99576 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSC22D3Q99576 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSC22D3Q99576 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSC22D3Q99576 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSC22D3Q99576 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSC22D3Q99576 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSC22D3Q99576 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSC22D3Q99576 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSC22D3Q99576 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSC22D3Q99576 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TSC22D3Q99576 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSC22D3Q99576 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSC22D3Q99576 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSC22D3Q99576 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSC22D3Q99576 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSC22D3Q99576 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSC22D3Q99576 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSC22D3Q99576 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSC22D3Q99576 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSC22D3Q99576 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TSC22D3Q99576 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSC22D3Q99576 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSC22D3Q99576 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSC22D3Q99576 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSC22D3Q99576 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSC22D3Q99576 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSC22D3Q99576 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSC22D3Q99576 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TSC22D3Q99576 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TSC22D3Q99576 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TSC22D3Q99576 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSC22D3Q99576 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSC22D3Q99576 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TSC22D3Q99576 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSC22D3Q99576 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSC22D3Q99576 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSC22D3Q99576 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TSC22D3Q99576 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TSC22D3Q99576 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TSC22D3Q99576 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TSC22D3Q99576 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TSC22D3Q99576 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TSC22D3Q99576 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TSC22D3Q99576 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TSC22D3Q99576 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TSC22D3Q99576 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TSC22D3Q99576 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSC22D3Q99576 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSC22D3Q99576 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSC22D3Q99576 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSC22D3Q99576 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TSC22D3Q99576 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TSC22D3Q99576 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TSC22D3Q99576 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSC22D3Q99576 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSC22D3Q99576 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSC22D3Q99576 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSC22D3Q99576 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSC22D3Q99576 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSC22D3Q99576 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSC22D3Q99576 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.6 ms