Protein–RNA interactions for Protein: Q99453

PHOX2B, Paired mesoderm homeobox protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2BQ99453 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PHOX2BQ99453 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PHOX2BQ99453 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PHOX2BQ99453 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PHOX2BQ99453 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PHOX2BQ99453 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PHOX2BQ99453 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PHOX2BQ99453 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PHOX2BQ99453 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PHOX2BQ99453 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PHOX2BQ99453 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PHOX2BQ99453 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PHOX2BQ99453 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PHOX2BQ99453 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PHOX2BQ99453 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PHOX2BQ99453 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PHOX2BQ99453 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PHOX2BQ99453 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PHOX2BQ99453 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PHOX2BQ99453 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PHOX2BQ99453 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PHOX2BQ99453 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PHOX2BQ99453 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PHOX2BQ99453 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PHOX2BQ99453 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PHOX2BQ99453 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PHOX2BQ99453 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PHOX2BQ99453 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PHOX2BQ99453 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PHOX2BQ99453 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PHOX2BQ99453 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PHOX2BQ99453 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PHOX2BQ99453 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
PHOX2BQ99453 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PHOX2BQ99453 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PHOX2BQ99453 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PHOX2BQ99453 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PHOX2BQ99453 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PHOX2BQ99453 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PHOX2BQ99453 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PHOX2BQ99453 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PHOX2BQ99453 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PHOX2BQ99453 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PHOX2BQ99453 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PHOX2BQ99453 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PHOX2BQ99453 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PHOX2BQ99453 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PHOX2BQ99453 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PHOX2BQ99453 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PHOX2BQ99453 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PHOX2BQ99453 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PHOX2BQ99453 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PHOX2BQ99453 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PHOX2BQ99453 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PHOX2BQ99453 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PHOX2BQ99453 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PHOX2BQ99453 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PHOX2BQ99453 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PHOX2BQ99453 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PHOX2BQ99453 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PHOX2BQ99453 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PHOX2BQ99453 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PHOX2BQ99453 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PHOX2BQ99453 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PHOX2BQ99453 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PHOX2BQ99453 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PHOX2BQ99453 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PHOX2BQ99453 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PHOX2BQ99453 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PHOX2BQ99453 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PHOX2BQ99453 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PHOX2BQ99453 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PHOX2BQ99453 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PHOX2BQ99453 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
PHOX2BQ99453 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PHOX2BQ99453 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
PHOX2BQ99453 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PHOX2BQ99453 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PHOX2BQ99453 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PHOX2BQ99453 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PHOX2BQ99453 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
PHOX2BQ99453 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PHOX2BQ99453 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PHOX2BQ99453 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PHOX2BQ99453 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PHOX2BQ99453 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PHOX2BQ99453 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PHOX2BQ99453 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PHOX2BQ99453 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PHOX2BQ99453 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PHOX2BQ99453 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PHOX2BQ99453 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PHOX2BQ99453 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PHOX2BQ99453 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PHOX2BQ99453 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PHOX2BQ99453 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PHOX2BQ99453 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PHOX2BQ99453 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PHOX2BQ99453 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PHOX2BQ99453 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms