Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ0

DCHS1, Protocadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 3,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1Q96JQ0 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DCHS1Q96JQ0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
DCHS1Q96JQ0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
DCHS1Q96JQ0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DCHS1Q96JQ0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DCHS1Q96JQ0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DCHS1Q96JQ0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DCHS1Q96JQ0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DCHS1Q96JQ0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DCHS1Q96JQ0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DCHS1Q96JQ0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DCHS1Q96JQ0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DCHS1Q96JQ0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DCHS1Q96JQ0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DCHS1Q96JQ0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DCHS1Q96JQ0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DCHS1Q96JQ0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DCHS1Q96JQ0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DCHS1Q96JQ0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DCHS1Q96JQ0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DCHS1Q96JQ0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DCHS1Q96JQ0 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DCHS1Q96JQ0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
DCHS1Q96JQ0 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DCHS1Q96JQ0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DCHS1Q96JQ0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DCHS1Q96JQ0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DCHS1Q96JQ0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DCHS1Q96JQ0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DCHS1Q96JQ0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
DCHS1Q96JQ0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DCHS1Q96JQ0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DCHS1Q96JQ0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DCHS1Q96JQ0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DCHS1Q96JQ0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DCHS1Q96JQ0 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DCHS1Q96JQ0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DCHS1Q96JQ0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DCHS1Q96JQ0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
DCHS1Q96JQ0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DCHS1Q96JQ0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DCHS1Q96JQ0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DCHS1Q96JQ0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DCHS1Q96JQ0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DCHS1Q96JQ0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DCHS1Q96JQ0 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DCHS1Q96JQ0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
DCHS1Q96JQ0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DCHS1Q96JQ0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.91
DCHS1Q96JQ0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DCHS1Q96JQ0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DCHS1Q96JQ0 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DCHS1Q96JQ0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DCHS1Q96JQ0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DCHS1Q96JQ0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DCHS1Q96JQ0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
DCHS1Q96JQ0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
DCHS1Q96JQ0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
DCHS1Q96JQ0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
DCHS1Q96JQ0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
DCHS1Q96JQ0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
DCHS1Q96JQ0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DCHS1Q96JQ0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DCHS1Q96JQ0 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DCHS1Q96JQ0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DCHS1Q96JQ0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DCHS1Q96JQ0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DCHS1Q96JQ0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DCHS1Q96JQ0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DCHS1Q96JQ0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DCHS1Q96JQ0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DCHS1Q96JQ0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DCHS1Q96JQ0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DCHS1Q96JQ0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DCHS1Q96JQ0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DCHS1Q96JQ0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
DCHS1Q96JQ0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DCHS1Q96JQ0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DCHS1Q96JQ0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DCHS1Q96JQ0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DCHS1Q96JQ0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DCHS1Q96JQ0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
DCHS1Q96JQ0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
DCHS1Q96JQ0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
DCHS1Q96JQ0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
DCHS1Q96JQ0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DCHS1Q96JQ0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DCHS1Q96JQ0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DCHS1Q96JQ0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DCHS1Q96JQ0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DCHS1Q96JQ0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DCHS1Q96JQ0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DCHS1Q96JQ0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
DCHS1Q96JQ0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DCHS1Q96JQ0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
DCHS1Q96JQ0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DCHS1Q96JQ0 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
DCHS1Q96JQ0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DCHS1Q96JQ0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DCHS1Q96JQ0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms