Protein–RNA interactions for Protein: Q96I24

FUBP3, Far upstream element-binding protein 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FUBP3Q96I24 UBAP2L-201ENST00000271877 3997 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.854e-8■■■■■ 38.6
FUBP3Q96I24 UBAP2L-208ENST00000433615 1789 ntTSL 1 (best)9.32□□□□□ -0.924e-8■■■■■ 38.6
FUBP3Q96I24 UBAP2L-203ENST00000361546 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.224e-8■■■■■ 38.6
FUBP3Q96I24 ROCK2-204ENST00000431087 729 ntTSL 37.25□□□□□ -1.254e-8■■■■■ 38.6
FUBP3Q96I24 GPATCH2-204ENST00000485274 343 ntTSL 36.51□□□□□ -1.374e-8■■■■■ 38.6
FUBP3Q96I24 SYPL1-205ENST00000470347 1193 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.424e-8■■■■■ 38.6
FUBP3Q96I24 GPATCH2-202ENST00000366935 5851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.434e-8■■■■■ 38.6
FUBP3Q96I24 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.434e-8■■■■■ 38.6
FUBP3Q96I24 SYPL1-204ENST00000464029 1017 ntTSL 25.92□□□□□ -1.464e-8■■■■■ 38.6
FUBP3Q96I24 UBAP2L-218ENST00000493867 677 ntTSL 35.59□□□□□ -1.514e-8■■■■■ 38.6
FUBP3Q96I24 GPATCH2-203ENST00000470014 442 ntTSL 35.35□□□□□ -1.554e-8■■■■■ 38.6
FUBP3Q96I24 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.692e-8■■■■■ 38.3
FUBP3Q96I24 CCNT2-204ENST00000419781 5414 ntTSL 1 (best)15.04■□□□□ -04e-9■■■■■ 38.2
FUBP3Q96I24 CCNT2-202ENST00000295238 4491 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.114e-9■■■■■ 38.2
FUBP3Q96I24 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.644e-9■■■■■ 38.2
FUBP3Q96I24 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 11e-9■■■■■ 38.1
FUBP3Q96I24 TMCO3-203ENST00000460039 864 ntTSL 317.31■□□□□ 0.361e-9■■■■■ 38.1
FUBP3Q96I24 TMCO3-209ENST00000619336 575 ntTSL 415.62■□□□□ 0.091e-9■■■■■ 38.1
FUBP3Q96I24 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.081e-9■■■■■ 38.1
FUBP3Q96I24 TMCO3-210ENST00000620021 3542 ntTSL 413.34□□□□□ -0.271e-9■■■■■ 38.1
FUBP3Q96I24 SMAD5-211ENST00000545279 7012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.321e-9■■■■■ 38.1
FUBP3Q96I24 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.671e-9■■■■■ 38.1
FUBP3Q96I24 SMAD5-208ENST00000513418 523 ntTSL 53.97□□□□□ -1.771e-9■■■■■ 38.1
FUBP3Q96I24 LRP6-203ENST00000538239 7812 ntTSL 1 (best)5.35□□□□□ -1.556e-11■■■■■ 37.8
FUBP3Q96I24 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.696e-11■■■■■ 37.8
FUBP3Q96I24 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.58e-28■■■■■ 37.6
FUBP3Q96I24 MSL1-201ENST00000339569 3424 ntTSL 25.14□□□□□ -1.598e-28■■■■■ 37.6
FUBP3Q96I24 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.192e-8■■■■■ 37.6
FUBP3Q96I24 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.339e-8■■■■■ 37.5
FUBP3Q96I24 TFPI-211ENST00000481132 7690 ntTSL 27.13□□□□□ -1.279e-8■■■■■ 37.5
FUBP3Q96I24 TFPI-204ENST00000409676 1119 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.39e-8■■■■■ 37.5
FUBP3Q96I24 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.349e-8■■■■■ 37.5
FUBP3Q96I24 TFPI-208ENST00000435414 687 ntTSL 54.95□□□□□ -1.629e-8■■■■■ 37.5
FUBP3Q96I24 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.553e-23■■■■■ 37.3
FUBP3Q96I24 AC068547.1-202ENST00000637224 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 58.22□□□□□ -1.093e-23■■■■■ 37.3
FUBP3Q96I24 AC068547.1-201ENST00000636024 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 56.14□□□□□ -1.433e-23■■■■■ 37.3
FUBP3Q96I24 ARL5A-203ENST00000446896 1268 ntTSL 26.09□□□□□ -1.433e-23■■■■■ 37.3
FUBP3Q96I24 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.321e-7■■■■■ 37.3
FUBP3Q96I24 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.381e-6■■■■■ 37.2
FUBP3Q96I24 FBXW11-201ENST00000265094 4342 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.551e-6■■■■■ 37.2
FUBP3Q96I24 CHD7-201ENST00000423902 11568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.033e-6■■■■■ 37
FUBP3Q96I24 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.678e-7■■■■■ 37
FUBP3Q96I24 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.688e-7■■■■■ 37
FUBP3Q96I24 ZNF292-202ENST00000369577 10610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.262e-8■■■■■ 36.9
FUBP3Q96I24 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.035e-7■■■■■ 36.8
FUBP3Q96I24 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.923e-9■■■■■ 36.6
FUBP3Q96I24 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.83e-9■■■■■ 36.6
FUBP3Q96I24 LIN28B-201ENST00000345080 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.223e-9■■■■■ 36.6
FUBP3Q96I24 TRMT112-204ENST00000537918 559 ntTSL 1 (best)20.18■□□□□ 0.826e-15■■■■■ 36.5
FUBP3Q96I24 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.576e-15■■■■■ 36.5
FUBP3Q96I24 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.516e-15■■■■■ 36.5
FUBP3Q96I24 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.346e-15■■■■■ 36.5
FUBP3Q96I24 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.146e-15■■■■■ 36.5
FUBP3Q96I24 TRMT112-205ENST00000539854 659 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.646e-15■■■■■ 36.5
FUBP3Q96I24 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.082e-6■■■■■ 36.4
FUBP3Q96I24 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.282e-6■■■■■ 36.4
FUBP3Q96I24 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.332e-6■■■■■ 36.4
FUBP3Q96I24 BCL2L11-217ENST00000610735 5120 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.352e-6■■■■■ 36.4
FUBP3Q96I24 BCL2L11-206ENST00000393256 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.492e-6■■■■■ 36.4
FUBP3Q96I24 BCL2L11-223ENST00000622612 4995 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.562e-6■■■■■ 36.4
FUBP3Q96I24 BCL2L11-220ENST00000620862 5044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.622e-6■■■■■ 36.4
FUBP3Q96I24 BCL2L11-218ENST00000615946 5026 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.622e-6■■■■■ 36.4
FUBP3Q96I24 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.295e-9■■■■■ 36.4
FUBP3Q96I24 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.162e-7■■■■■ 36.3
FUBP3Q96I24 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -02e-7■■■■■ 36.3
FUBP3Q96I24 SPRY1-202ENST00000394339 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.12e-7■■■■■ 36.3
FUBP3Q96I24 SPRY1-201ENST00000339241 2348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.192e-7■■■■■ 36.3
FUBP3Q96I24 FAM234B-202ENST00000416494 2623 ntTSL 211.86□□□□□ -0.515e-7■■■■■ 36.3
FUBP3Q96I24 FAM234B-201ENST00000197268 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.645e-7■■■■■ 36.3
FUBP3Q96I24 FAM234B-204ENST00000537625 2011 ntTSL 1 (best)9□□□□□ -0.975e-7■■■■■ 36.3
FUBP3Q96I24 FAM234B-206ENST00000541950 1586 ntTSL 28.39□□□□□ -1.075e-7■■■■■ 36.3
FUBP3Q96I24 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC3.37□□□□□ -1.877e-8■■■■■ 36.3
FUBP3Q96I24 PPP1R12A-201ENST00000261207 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.368e-8■■■■■ 36.2
FUBP3Q96I24 PPP1R12A-203ENST00000450142 5721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.638e-8■■■■■ 36.2
FUBP3Q96I24 ROCK2-201ENST00000261535 1795 ntTSL 523.16■■□□□ 1.32e-7■■■■■ 36.2
FUBP3Q96I24 HDAC4-217ENST00000553145 552 ntTSL 420.07■□□□□ 0.81e-7■■■■■ 36.2
FUBP3Q96I24 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.361e-7■■■■■ 36.2
FUBP3Q96I24 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.343e-14■■■■■ 36.2
FUBP3Q96I24 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.261e-7■■■■■ 36.2
FUBP3Q96I24 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.212e-7■■■■■ 36.2
FUBP3Q96I24 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.071e-7■■■■■ 36.2
FUBP3Q96I24 HDAC4-207ENST00000461113 1019 ntTSL 1 (best)13.3□□□□□ -0.281e-7■■■■■ 36.2
FUBP3Q96I24 HDAC4-214ENST00000535493 2743 ntTSL 212.95□□□□□ -0.341e-7■■■■■ 36.2
FUBP3Q96I24 ACVR2A-202ENST00000404590 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41e-7■■■■■ 36.2
FUBP3Q96I24 YEATS2-201ENST00000305135 6506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.431e-7■■■■■ 36.2
FUBP3Q96I24 ACVR2A-201ENST00000241416 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.441e-7■■■■■ 36.2
FUBP3Q96I24 HDAC4-208ENST00000463007 3158 ntTSL 1 (best)12.27□□□□□ -0.441e-7■■■■■ 36.2
FUBP3Q96I24 SIRT5-204ENST00000397350 4382 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.581e-7■■■■■ 36.2
FUBP3Q96I24 SLTM-212ENST00000557924 3021 ntTSL 210.89□□□□□ -0.671e-7■■■■■ 36.2
FUBP3Q96I24 KLHL24-205ENST00000454652 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.712e-7■■■■■ 36.2
FUBP3Q96I24 YEATS2-204ENST00000472593 5737 ntTSL 210.31□□□□□ -0.761e-7■■■■■ 36.2
FUBP3Q96I24 TMTC4-202ENST00000342624 3602 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.91e-7■■■■■ 36.2
FUBP3Q96I24 SIRT5-205ENST00000606117 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.981e-7■■■■■ 36.2
FUBP3Q96I24 ACVR2A-207ENST00000535787 5166 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.991e-7■■■■■ 36.2
FUBP3Q96I24 SIRT5-202ENST00000379250 3727 ntTSL 1 (best)8.88□□□□□ -0.991e-7■■■■■ 36.2
FUBP3Q96I24 SIRT5-201ENST00000359782 3797 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.021e-7■■■■■ 36.2
FUBP3Q96I24 ROCK2-206ENST00000462366 563 ntTSL 37.25□□□□□ -1.252e-7■■■■■ 36.2
FUBP3Q96I24 TANK-205ENST00000405852 2155 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.571e-7■■■■■ 36.2
FUBP3Q96I24 TANK-210ENST00000437623 1702 ntTSL 53.79□□□□□ -1.81e-7■■■■■ 36.2
FUBP3Q96I24 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.931e-7■■■■■ 36.2
Retrieved 100 of 4,568 protein–RNA pairs in 244.7 ms