Protein–RNA interactions for Protein: Q96G97

BSCL2, Seipin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BSCL2Q96G97 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BSCL2Q96G97 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BSCL2Q96G97 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BSCL2Q96G97 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BSCL2Q96G97 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BSCL2Q96G97 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
BSCL2Q96G97 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BSCL2Q96G97 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BSCL2Q96G97 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BSCL2Q96G97 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BSCL2Q96G97 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BSCL2Q96G97 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BSCL2Q96G97 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BSCL2Q96G97 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BSCL2Q96G97 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BSCL2Q96G97 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BSCL2Q96G97 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BSCL2Q96G97 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BSCL2Q96G97 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BSCL2Q96G97 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BSCL2Q96G97 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BSCL2Q96G97 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BSCL2Q96G97 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BSCL2Q96G97 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BSCL2Q96G97 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BSCL2Q96G97 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BSCL2Q96G97 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BSCL2Q96G97 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BSCL2Q96G97 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BSCL2Q96G97 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BSCL2Q96G97 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BSCL2Q96G97 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BSCL2Q96G97 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BSCL2Q96G97 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BSCL2Q96G97 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BSCL2Q96G97 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BSCL2Q96G97 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BSCL2Q96G97 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BSCL2Q96G97 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BSCL2Q96G97 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BSCL2Q96G97 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BSCL2Q96G97 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BSCL2Q96G97 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BSCL2Q96G97 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BSCL2Q96G97 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BSCL2Q96G97 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BSCL2Q96G97 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BSCL2Q96G97 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
BSCL2Q96G97 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
BSCL2Q96G97 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BSCL2Q96G97 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BSCL2Q96G97 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BSCL2Q96G97 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BSCL2Q96G97 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BSCL2Q96G97 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BSCL2Q96G97 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BSCL2Q96G97 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BSCL2Q96G97 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BSCL2Q96G97 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BSCL2Q96G97 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BSCL2Q96G97 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BSCL2Q96G97 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BSCL2Q96G97 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BSCL2Q96G97 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BSCL2Q96G97 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BSCL2Q96G97 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BSCL2Q96G97 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BSCL2Q96G97 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BSCL2Q96G97 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BSCL2Q96G97 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BSCL2Q96G97 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BSCL2Q96G97 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BSCL2Q96G97 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BSCL2Q96G97 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BSCL2Q96G97 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BSCL2Q96G97 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BSCL2Q96G97 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BSCL2Q96G97 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BSCL2Q96G97 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BSCL2Q96G97 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BSCL2Q96G97 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BSCL2Q96G97 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BSCL2Q96G97 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BSCL2Q96G97 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BSCL2Q96G97 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BSCL2Q96G97 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BSCL2Q96G97 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BSCL2Q96G97 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BSCL2Q96G97 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BSCL2Q96G97 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
BSCL2Q96G97 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BSCL2Q96G97 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BSCL2Q96G97 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BSCL2Q96G97 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BSCL2Q96G97 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BSCL2Q96G97 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BSCL2Q96G97 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BSCL2Q96G97 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BSCL2Q96G97 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BSCL2Q96G97 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms