Protein–RNA interactions for Protein: Q96FX7

TRMT61A, tRNA (adenine(58)-N(1))-methyltransferase catalytic subunit TRMT61A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT61AQ96FX7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRMT61AQ96FX7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TRMT61AQ96FX7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRMT61AQ96FX7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRMT61AQ96FX7 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRMT61AQ96FX7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRMT61AQ96FX7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRMT61AQ96FX7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRMT61AQ96FX7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRMT61AQ96FX7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRMT61AQ96FX7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRMT61AQ96FX7 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRMT61AQ96FX7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRMT61AQ96FX7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRMT61AQ96FX7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRMT61AQ96FX7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRMT61AQ96FX7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRMT61AQ96FX7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRMT61AQ96FX7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRMT61AQ96FX7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRMT61AQ96FX7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TRMT61AQ96FX7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRMT61AQ96FX7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRMT61AQ96FX7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRMT61AQ96FX7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRMT61AQ96FX7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRMT61AQ96FX7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TRMT61AQ96FX7 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRMT61AQ96FX7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TRMT61AQ96FX7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRMT61AQ96FX7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRMT61AQ96FX7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRMT61AQ96FX7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRMT61AQ96FX7 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRMT61AQ96FX7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRMT61AQ96FX7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRMT61AQ96FX7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRMT61AQ96FX7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRMT61AQ96FX7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRMT61AQ96FX7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRMT61AQ96FX7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRMT61AQ96FX7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRMT61AQ96FX7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRMT61AQ96FX7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRMT61AQ96FX7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRMT61AQ96FX7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRMT61AQ96FX7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRMT61AQ96FX7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRMT61AQ96FX7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRMT61AQ96FX7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRMT61AQ96FX7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRMT61AQ96FX7 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRMT61AQ96FX7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRMT61AQ96FX7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRMT61AQ96FX7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRMT61AQ96FX7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRMT61AQ96FX7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRMT61AQ96FX7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TRMT61AQ96FX7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRMT61AQ96FX7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRMT61AQ96FX7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRMT61AQ96FX7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRMT61AQ96FX7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRMT61AQ96FX7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TRMT61AQ96FX7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRMT61AQ96FX7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRMT61AQ96FX7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRMT61AQ96FX7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRMT61AQ96FX7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRMT61AQ96FX7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRMT61AQ96FX7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRMT61AQ96FX7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRMT61AQ96FX7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRMT61AQ96FX7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRMT61AQ96FX7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRMT61AQ96FX7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRMT61AQ96FX7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRMT61AQ96FX7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRMT61AQ96FX7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRMT61AQ96FX7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRMT61AQ96FX7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRMT61AQ96FX7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRMT61AQ96FX7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRMT61AQ96FX7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRMT61AQ96FX7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRMT61AQ96FX7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRMT61AQ96FX7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRMT61AQ96FX7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRMT61AQ96FX7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRMT61AQ96FX7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRMT61AQ96FX7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRMT61AQ96FX7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TRMT61AQ96FX7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRMT61AQ96FX7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRMT61AQ96FX7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRMT61AQ96FX7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRMT61AQ96FX7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRMT61AQ96FX7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRMT61AQ96FX7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRMT61AQ96FX7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms