Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
SIRT1Q96EB6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.57■■■■□ 3.76
SIRT1Q96EB6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.57■■■■□ 3.76
SIRT1Q96EB6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC38.56■■■■□ 3.76
SIRT1Q96EB6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.56■■■■□ 3.76
SIRT1Q96EB6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
SIRT1Q96EB6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
SIRT1Q96EB6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
SIRT1Q96EB6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
SIRT1Q96EB6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
SIRT1Q96EB6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
SIRT1Q96EB6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
SIRT1Q96EB6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
SIRT1Q96EB6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC38.45■■■■□ 3.75
SIRT1Q96EB6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC38.45■■■■□ 3.75
SIRT1Q96EB6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC38.44■■■■□ 3.74
SIRT1Q96EB6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
SIRT1Q96EB6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC38.41■■■■□ 3.74
SIRT1Q96EB6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC38.41■■■■□ 3.74
SIRT1Q96EB6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC38.41■■■■□ 3.74
SIRT1Q96EB6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
SIRT1Q96EB6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
SIRT1Q96EB6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
SIRT1Q96EB6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
SIRT1Q96EB6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
SIRT1Q96EB6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC38.39■■■■□ 3.74
SIRT1Q96EB6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
SIRT1Q96EB6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
SIRT1Q96EB6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
SIRT1Q96EB6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
SIRT1Q96EB6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
SIRT1Q96EB6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
SIRT1Q96EB6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC38.31■■■■□ 3.72
SIRT1Q96EB6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
SIRT1Q96EB6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
SIRT1Q96EB6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC38.29■■■■□ 3.72
SIRT1Q96EB6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
SIRT1Q96EB6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
SIRT1Q96EB6 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
SIRT1Q96EB6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
SIRT1Q96EB6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC38.28■■■■□ 3.72
SIRT1Q96EB6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
SIRT1Q96EB6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
SIRT1Q96EB6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
SIRT1Q96EB6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
SIRT1Q96EB6 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
SIRT1Q96EB6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
SIRT1Q96EB6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
SIRT1Q96EB6 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
SIRT1Q96EB6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC38.24■■■■□ 3.71
SIRT1Q96EB6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
SIRT1Q96EB6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
SIRT1Q96EB6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
SIRT1Q96EB6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
SIRT1Q96EB6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC38.21■■■■□ 3.71
SIRT1Q96EB6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
SIRT1Q96EB6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
SIRT1Q96EB6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
SIRT1Q96EB6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
SIRT1Q96EB6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
SIRT1Q96EB6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
SIRT1Q96EB6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC38.17■■■■□ 3.7
SIRT1Q96EB6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC38.16■■■■□ 3.7
SIRT1Q96EB6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC38.16■■■■□ 3.7
SIRT1Q96EB6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
SIRT1Q96EB6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
SIRT1Q96EB6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
SIRT1Q96EB6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC38.13■■■■□ 3.69
SIRT1Q96EB6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.69
SIRT1Q96EB6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
SIRT1Q96EB6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
SIRT1Q96EB6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
SIRT1Q96EB6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
SIRT1Q96EB6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
SIRT1Q96EB6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
SIRT1Q96EB6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
SIRT1Q96EB6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC38.06■■■■□ 3.68
SIRT1Q96EB6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC38.05■■■■□ 3.68
SIRT1Q96EB6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
SIRT1Q96EB6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
SIRT1Q96EB6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.68
SIRT1Q96EB6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC38■■■■□ 3.67
SIRT1Q96EB6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
SIRT1Q96EB6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
SIRT1Q96EB6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
SIRT1Q96EB6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
SIRT1Q96EB6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
SIRT1Q96EB6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
SIRT1Q96EB6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
SIRT1Q96EB6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
SIRT1Q96EB6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
SIRT1Q96EB6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
SIRT1Q96EB6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
SIRT1Q96EB6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC37.94■■■■□ 3.66
SIRT1Q96EB6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC37.94■■■■□ 3.66
SIRT1Q96EB6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
SIRT1Q96EB6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
SIRT1Q96EB6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
SIRT1Q96EB6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
SIRT1Q96EB6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC37.9■■■■□ 3.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms