Protein–RNA interactions for Protein: Q96DN2

VWCE, von Willebrand factor C and EGF domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWCEQ96DN2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
VWCEQ96DN2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
VWCEQ96DN2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
VWCEQ96DN2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
VWCEQ96DN2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
VWCEQ96DN2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
VWCEQ96DN2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
VWCEQ96DN2 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
VWCEQ96DN2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC30.16■■■□□ 2.42
VWCEQ96DN2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
VWCEQ96DN2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
VWCEQ96DN2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
VWCEQ96DN2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
VWCEQ96DN2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
VWCEQ96DN2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
VWCEQ96DN2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC30.11■■■□□ 2.41
VWCEQ96DN2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
VWCEQ96DN2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
VWCEQ96DN2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
VWCEQ96DN2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
VWCEQ96DN2 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
VWCEQ96DN2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
VWCEQ96DN2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
VWCEQ96DN2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
VWCEQ96DN2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
VWCEQ96DN2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
VWCEQ96DN2 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
VWCEQ96DN2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
VWCEQ96DN2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
VWCEQ96DN2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
VWCEQ96DN2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
VWCEQ96DN2 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
VWCEQ96DN2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
VWCEQ96DN2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
VWCEQ96DN2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
VWCEQ96DN2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.95■■■□□ 2.39
VWCEQ96DN2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
VWCEQ96DN2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
VWCEQ96DN2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
VWCEQ96DN2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
VWCEQ96DN2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
VWCEQ96DN2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
VWCEQ96DN2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
VWCEQ96DN2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
VWCEQ96DN2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
VWCEQ96DN2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
VWCEQ96DN2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
VWCEQ96DN2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
VWCEQ96DN2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
VWCEQ96DN2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
VWCEQ96DN2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
VWCEQ96DN2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
VWCEQ96DN2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
VWCEQ96DN2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
VWCEQ96DN2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
VWCEQ96DN2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
VWCEQ96DN2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
VWCEQ96DN2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
VWCEQ96DN2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
VWCEQ96DN2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
VWCEQ96DN2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
VWCEQ96DN2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
VWCEQ96DN2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
VWCEQ96DN2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
VWCEQ96DN2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
VWCEQ96DN2 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
VWCEQ96DN2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
VWCEQ96DN2 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
VWCEQ96DN2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
VWCEQ96DN2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
VWCEQ96DN2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
VWCEQ96DN2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
VWCEQ96DN2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
VWCEQ96DN2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
VWCEQ96DN2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
VWCEQ96DN2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
VWCEQ96DN2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
VWCEQ96DN2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
VWCEQ96DN2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
VWCEQ96DN2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
VWCEQ96DN2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
VWCEQ96DN2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
VWCEQ96DN2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
VWCEQ96DN2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.64■■■□□ 2.34
VWCEQ96DN2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
VWCEQ96DN2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
VWCEQ96DN2 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
VWCEQ96DN2 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
VWCEQ96DN2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
VWCEQ96DN2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
VWCEQ96DN2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
VWCEQ96DN2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
VWCEQ96DN2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
VWCEQ96DN2 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
VWCEQ96DN2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
VWCEQ96DN2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
VWCEQ96DN2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
VWCEQ96DN2 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
VWCEQ96DN2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
VWCEQ96DN2 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms