Protein–RNA interactions for Protein: Q92858

ATOH1, Protein atonal homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATOH1Q92858 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ATOH1Q92858 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATOH1Q92858 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATOH1Q92858 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATOH1Q92858 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATOH1Q92858 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATOH1Q92858 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATOH1Q92858 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ATOH1Q92858 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ATOH1Q92858 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATOH1Q92858 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATOH1Q92858 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATOH1Q92858 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
ATOH1Q92858 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
ATOH1Q92858 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATOH1Q92858 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATOH1Q92858 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATOH1Q92858 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATOH1Q92858 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATOH1Q92858 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATOH1Q92858 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATOH1Q92858 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATOH1Q92858 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATOH1Q92858 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATOH1Q92858 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
ATOH1Q92858 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATOH1Q92858 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATOH1Q92858 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATOH1Q92858 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATOH1Q92858 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATOH1Q92858 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATOH1Q92858 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATOH1Q92858 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATOH1Q92858 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATOH1Q92858 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATOH1Q92858 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATOH1Q92858 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATOH1Q92858 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATOH1Q92858 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATOH1Q92858 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATOH1Q92858 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATOH1Q92858 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATOH1Q92858 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATOH1Q92858 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATOH1Q92858 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATOH1Q92858 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATOH1Q92858 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATOH1Q92858 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATOH1Q92858 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATOH1Q92858 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATOH1Q92858 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATOH1Q92858 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ATOH1Q92858 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATOH1Q92858 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
ATOH1Q92858 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATOH1Q92858 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATOH1Q92858 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
ATOH1Q92858 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
ATOH1Q92858 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
ATOH1Q92858 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATOH1Q92858 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATOH1Q92858 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATOH1Q92858 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATOH1Q92858 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATOH1Q92858 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATOH1Q92858 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATOH1Q92858 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATOH1Q92858 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ATOH1Q92858 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
ATOH1Q92858 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ATOH1Q92858 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATOH1Q92858 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATOH1Q92858 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATOH1Q92858 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATOH1Q92858 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATOH1Q92858 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATOH1Q92858 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ATOH1Q92858 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATOH1Q92858 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATOH1Q92858 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATOH1Q92858 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATOH1Q92858 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATOH1Q92858 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATOH1Q92858 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATOH1Q92858 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATOH1Q92858 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATOH1Q92858 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATOH1Q92858 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ATOH1Q92858 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATOH1Q92858 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATOH1Q92858 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATOH1Q92858 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
ATOH1Q92858 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATOH1Q92858 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATOH1Q92858 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATOH1Q92858 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATOH1Q92858 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATOH1Q92858 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATOH1Q92858 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATOH1Q92858 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms