Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
PTPRUQ92729 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
PTPRUQ92729 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC39.13■■■■□ 3.85
PTPRUQ92729 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC39.12■■■■□ 3.85
PTPRUQ92729 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC39.12■■■■□ 3.85
PTPRUQ92729 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
PTPRUQ92729 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
PTPRUQ92729 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC39.08■■■■□ 3.85
PTPRUQ92729 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC39.08■■■■□ 3.85
PTPRUQ92729 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
PTPRUQ92729 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
PTPRUQ92729 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC39.05■■■■□ 3.84
PTPRUQ92729 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC39.04■■■■□ 3.84
PTPRUQ92729 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
PTPRUQ92729 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC39.02■■■■□ 3.84
PTPRUQ92729 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC39■■■■□ 3.83
PTPRUQ92729 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC39■■■■□ 3.83
PTPRUQ92729 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
PTPRUQ92729 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.98■■■■□ 3.83
PTPRUQ92729 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
PTPRUQ92729 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
PTPRUQ92729 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.97■■■■□ 3.83
PTPRUQ92729 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
PTPRUQ92729 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
PTPRUQ92729 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.95■■■■□ 3.83
PTPRUQ92729 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC38.94■■■■□ 3.82
PTPRUQ92729 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.94■■■■□ 3.82
PTPRUQ92729 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
PTPRUQ92729 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
PTPRUQ92729 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
PTPRUQ92729 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
PTPRUQ92729 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC38.89■■■■□ 3.82
PTPRUQ92729 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC38.87■■■■□ 3.81
PTPRUQ92729 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
PTPRUQ92729 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
PTPRUQ92729 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC38.85■■■■□ 3.81
PTPRUQ92729 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC38.82■■■■□ 3.81
PTPRUQ92729 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC38.82■■■■□ 3.81
PTPRUQ92729 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC38.81■■■■□ 3.8
PTPRUQ92729 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC38.81■■■■□ 3.8
PTPRUQ92729 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
PTPRUQ92729 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
PTPRUQ92729 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC38.8■■■■□ 3.8
PTPRUQ92729 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
PTPRUQ92729 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC38.79■■■■□ 3.8
PTPRUQ92729 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
PTPRUQ92729 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.79
PTPRUQ92729 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
PTPRUQ92729 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC38.75■■■■□ 3.79
PTPRUQ92729 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
PTPRUQ92729 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
PTPRUQ92729 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC38.72■■■■□ 3.79
PTPRUQ92729 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC38.7■■■■□ 3.79
PTPRUQ92729 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
PTPRUQ92729 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
PTPRUQ92729 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
PTPRUQ92729 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
PTPRUQ92729 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC38.67■■■■□ 3.78
PTPRUQ92729 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
PTPRUQ92729 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC38.65■■■■□ 3.78
PTPRUQ92729 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
PTPRUQ92729 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
PTPRUQ92729 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
PTPRUQ92729 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC38.61■■■■□ 3.77
PTPRUQ92729 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
PTPRUQ92729 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC38.6■■■■□ 3.77
PTPRUQ92729 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
PTPRUQ92729 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
PTPRUQ92729 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
PTPRUQ92729 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC38.55■■■■□ 3.76
PTPRUQ92729 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
PTPRUQ92729 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC38.55■■■■□ 3.76
PTPRUQ92729 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
PTPRUQ92729 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC38.51■■■■□ 3.76
PTPRUQ92729 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
PTPRUQ92729 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC38.5■■■■□ 3.75
PTPRUQ92729 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC38.49■■■■□ 3.75
PTPRUQ92729 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC38.49■■■■□ 3.75
PTPRUQ92729 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC38.49■■■■□ 3.75
PTPRUQ92729 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
PTPRUQ92729 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
PTPRUQ92729 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC38.46■■■■□ 3.75
PTPRUQ92729 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
PTPRUQ92729 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC38.44■■■■□ 3.74
PTPRUQ92729 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC38.43■■■■□ 3.74
PTPRUQ92729 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC38.43■■■■□ 3.74
PTPRUQ92729 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
PTPRUQ92729 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
PTPRUQ92729 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
PTPRUQ92729 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.73
PTPRUQ92729 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC38.38■■■■□ 3.73
PTPRUQ92729 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
PTPRUQ92729 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
PTPRUQ92729 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
PTPRUQ92729 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC38.32■■■■□ 3.73
PTPRUQ92729 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
PTPRUQ92729 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC38.31■■■■□ 3.72
PTPRUQ92729 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
PTPRUQ92729 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
PTPRUQ92729 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms