Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF8

DEDD2, DNA-binding death effector domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEDD2Q8WXF8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DEDD2Q8WXF8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DEDD2Q8WXF8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DEDD2Q8WXF8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DEDD2Q8WXF8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DEDD2Q8WXF8 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DEDD2Q8WXF8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DEDD2Q8WXF8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DEDD2Q8WXF8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DEDD2Q8WXF8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DEDD2Q8WXF8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DEDD2Q8WXF8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DEDD2Q8WXF8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DEDD2Q8WXF8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DEDD2Q8WXF8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DEDD2Q8WXF8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DEDD2Q8WXF8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DEDD2Q8WXF8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DEDD2Q8WXF8 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DEDD2Q8WXF8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DEDD2Q8WXF8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DEDD2Q8WXF8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DEDD2Q8WXF8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DEDD2Q8WXF8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DEDD2Q8WXF8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DEDD2Q8WXF8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DEDD2Q8WXF8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DEDD2Q8WXF8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DEDD2Q8WXF8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DEDD2Q8WXF8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DEDD2Q8WXF8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DEDD2Q8WXF8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DEDD2Q8WXF8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DEDD2Q8WXF8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DEDD2Q8WXF8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DEDD2Q8WXF8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DEDD2Q8WXF8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DEDD2Q8WXF8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DEDD2Q8WXF8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DEDD2Q8WXF8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DEDD2Q8WXF8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DEDD2Q8WXF8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DEDD2Q8WXF8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DEDD2Q8WXF8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DEDD2Q8WXF8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DEDD2Q8WXF8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DEDD2Q8WXF8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DEDD2Q8WXF8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DEDD2Q8WXF8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DEDD2Q8WXF8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DEDD2Q8WXF8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DEDD2Q8WXF8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DEDD2Q8WXF8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DEDD2Q8WXF8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DEDD2Q8WXF8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DEDD2Q8WXF8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DEDD2Q8WXF8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DEDD2Q8WXF8 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DEDD2Q8WXF8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DEDD2Q8WXF8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DEDD2Q8WXF8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DEDD2Q8WXF8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DEDD2Q8WXF8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DEDD2Q8WXF8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DEDD2Q8WXF8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DEDD2Q8WXF8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DEDD2Q8WXF8 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DEDD2Q8WXF8 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DEDD2Q8WXF8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DEDD2Q8WXF8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DEDD2Q8WXF8 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DEDD2Q8WXF8 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DEDD2Q8WXF8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DEDD2Q8WXF8 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DEDD2Q8WXF8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DEDD2Q8WXF8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DEDD2Q8WXF8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DEDD2Q8WXF8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DEDD2Q8WXF8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DEDD2Q8WXF8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DEDD2Q8WXF8 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DEDD2Q8WXF8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DEDD2Q8WXF8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DEDD2Q8WXF8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DEDD2Q8WXF8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DEDD2Q8WXF8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DEDD2Q8WXF8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DEDD2Q8WXF8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DEDD2Q8WXF8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DEDD2Q8WXF8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DEDD2Q8WXF8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23■■□□□ 1.27
DEDD2Q8WXF8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DEDD2Q8WXF8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DEDD2Q8WXF8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DEDD2Q8WXF8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DEDD2Q8WXF8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DEDD2Q8WXF8 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DEDD2Q8WXF8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DEDD2Q8WXF8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DEDD2Q8WXF8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms