Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW12

PCNP, PEST proteolytic signal-containing nuclear protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNPQ8WW12 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCNPQ8WW12 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCNPQ8WW12 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCNPQ8WW12 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCNPQ8WW12 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCNPQ8WW12 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCNPQ8WW12 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCNPQ8WW12 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCNPQ8WW12 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCNPQ8WW12 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCNPQ8WW12 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCNPQ8WW12 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCNPQ8WW12 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCNPQ8WW12 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCNPQ8WW12 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCNPQ8WW12 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCNPQ8WW12 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCNPQ8WW12 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCNPQ8WW12 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCNPQ8WW12 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCNPQ8WW12 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCNPQ8WW12 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCNPQ8WW12 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCNPQ8WW12 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCNPQ8WW12 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCNPQ8WW12 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCNPQ8WW12 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCNPQ8WW12 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCNPQ8WW12 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCNPQ8WW12 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCNPQ8WW12 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCNPQ8WW12 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCNPQ8WW12 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCNPQ8WW12 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCNPQ8WW12 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCNPQ8WW12 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCNPQ8WW12 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCNPQ8WW12 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCNPQ8WW12 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCNPQ8WW12 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCNPQ8WW12 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCNPQ8WW12 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCNPQ8WW12 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCNPQ8WW12 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCNPQ8WW12 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCNPQ8WW12 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCNPQ8WW12 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCNPQ8WW12 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCNPQ8WW12 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCNPQ8WW12 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCNPQ8WW12 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCNPQ8WW12 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCNPQ8WW12 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCNPQ8WW12 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCNPQ8WW12 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCNPQ8WW12 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCNPQ8WW12 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCNPQ8WW12 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCNPQ8WW12 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCNPQ8WW12 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCNPQ8WW12 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCNPQ8WW12 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCNPQ8WW12 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCNPQ8WW12 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCNPQ8WW12 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCNPQ8WW12 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCNPQ8WW12 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCNPQ8WW12 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCNPQ8WW12 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCNPQ8WW12 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCNPQ8WW12 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCNPQ8WW12 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCNPQ8WW12 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCNPQ8WW12 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCNPQ8WW12 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCNPQ8WW12 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCNPQ8WW12 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCNPQ8WW12 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCNPQ8WW12 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCNPQ8WW12 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCNPQ8WW12 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCNPQ8WW12 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCNPQ8WW12 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCNPQ8WW12 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCNPQ8WW12 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCNPQ8WW12 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCNPQ8WW12 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCNPQ8WW12 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCNPQ8WW12 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCNPQ8WW12 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCNPQ8WW12 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCNPQ8WW12 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCNPQ8WW12 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCNPQ8WW12 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCNPQ8WW12 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCNPQ8WW12 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PCNPQ8WW12 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCNPQ8WW12 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCNPQ8WW12 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCNPQ8WW12 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms