Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVK7

SKA2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKA2Q8WVK7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SKA2Q8WVK7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SKA2Q8WVK7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SKA2Q8WVK7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SKA2Q8WVK7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SKA2Q8WVK7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SKA2Q8WVK7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SKA2Q8WVK7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SKA2Q8WVK7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SKA2Q8WVK7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SKA2Q8WVK7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SKA2Q8WVK7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SKA2Q8WVK7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SKA2Q8WVK7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SKA2Q8WVK7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SKA2Q8WVK7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SKA2Q8WVK7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SKA2Q8WVK7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SKA2Q8WVK7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SKA2Q8WVK7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SKA2Q8WVK7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SKA2Q8WVK7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SKA2Q8WVK7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SKA2Q8WVK7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SKA2Q8WVK7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SKA2Q8WVK7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SKA2Q8WVK7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SKA2Q8WVK7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SKA2Q8WVK7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SKA2Q8WVK7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SKA2Q8WVK7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SKA2Q8WVK7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SKA2Q8WVK7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SKA2Q8WVK7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SKA2Q8WVK7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SKA2Q8WVK7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SKA2Q8WVK7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SKA2Q8WVK7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SKA2Q8WVK7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SKA2Q8WVK7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SKA2Q8WVK7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SKA2Q8WVK7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SKA2Q8WVK7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SKA2Q8WVK7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SKA2Q8WVK7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SKA2Q8WVK7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SKA2Q8WVK7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SKA2Q8WVK7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SKA2Q8WVK7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SKA2Q8WVK7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SKA2Q8WVK7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SKA2Q8WVK7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SKA2Q8WVK7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SKA2Q8WVK7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SKA2Q8WVK7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SKA2Q8WVK7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SKA2Q8WVK7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SKA2Q8WVK7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SKA2Q8WVK7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SKA2Q8WVK7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SKA2Q8WVK7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SKA2Q8WVK7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SKA2Q8WVK7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SKA2Q8WVK7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SKA2Q8WVK7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SKA2Q8WVK7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SKA2Q8WVK7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SKA2Q8WVK7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SKA2Q8WVK7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SKA2Q8WVK7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SKA2Q8WVK7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SKA2Q8WVK7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SKA2Q8WVK7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SKA2Q8WVK7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SKA2Q8WVK7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SKA2Q8WVK7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SKA2Q8WVK7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SKA2Q8WVK7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SKA2Q8WVK7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SKA2Q8WVK7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SKA2Q8WVK7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SKA2Q8WVK7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SKA2Q8WVK7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SKA2Q8WVK7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SKA2Q8WVK7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SKA2Q8WVK7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SKA2Q8WVK7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SKA2Q8WVK7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SKA2Q8WVK7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SKA2Q8WVK7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SKA2Q8WVK7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SKA2Q8WVK7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SKA2Q8WVK7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SKA2Q8WVK7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SKA2Q8WVK7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SKA2Q8WVK7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SKA2Q8WVK7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SKA2Q8WVK7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SKA2Q8WVK7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SKA2Q8WVK7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms