Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTV0

SCARB1, Scavenger receptor class B member 1, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB1Q8WTV0 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCARB1Q8WTV0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCARB1Q8WTV0 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCARB1Q8WTV0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCARB1Q8WTV0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCARB1Q8WTV0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCARB1Q8WTV0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCARB1Q8WTV0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCARB1Q8WTV0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCARB1Q8WTV0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCARB1Q8WTV0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCARB1Q8WTV0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCARB1Q8WTV0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCARB1Q8WTV0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCARB1Q8WTV0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCARB1Q8WTV0 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCARB1Q8WTV0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCARB1Q8WTV0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCARB1Q8WTV0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCARB1Q8WTV0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCARB1Q8WTV0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCARB1Q8WTV0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCARB1Q8WTV0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCARB1Q8WTV0 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCARB1Q8WTV0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCARB1Q8WTV0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCARB1Q8WTV0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCARB1Q8WTV0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCARB1Q8WTV0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCARB1Q8WTV0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCARB1Q8WTV0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCARB1Q8WTV0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCARB1Q8WTV0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCARB1Q8WTV0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCARB1Q8WTV0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCARB1Q8WTV0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCARB1Q8WTV0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCARB1Q8WTV0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCARB1Q8WTV0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCARB1Q8WTV0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCARB1Q8WTV0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCARB1Q8WTV0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCARB1Q8WTV0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCARB1Q8WTV0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCARB1Q8WTV0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SCARB1Q8WTV0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCARB1Q8WTV0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCARB1Q8WTV0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCARB1Q8WTV0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCARB1Q8WTV0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCARB1Q8WTV0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCARB1Q8WTV0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCARB1Q8WTV0 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCARB1Q8WTV0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCARB1Q8WTV0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCARB1Q8WTV0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCARB1Q8WTV0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCARB1Q8WTV0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCARB1Q8WTV0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCARB1Q8WTV0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCARB1Q8WTV0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCARB1Q8WTV0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCARB1Q8WTV0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCARB1Q8WTV0 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCARB1Q8WTV0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCARB1Q8WTV0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCARB1Q8WTV0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCARB1Q8WTV0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCARB1Q8WTV0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCARB1Q8WTV0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SCARB1Q8WTV0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCARB1Q8WTV0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCARB1Q8WTV0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCARB1Q8WTV0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCARB1Q8WTV0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCARB1Q8WTV0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCARB1Q8WTV0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SCARB1Q8WTV0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCARB1Q8WTV0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCARB1Q8WTV0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCARB1Q8WTV0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCARB1Q8WTV0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCARB1Q8WTV0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCARB1Q8WTV0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCARB1Q8WTV0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCARB1Q8WTV0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCARB1Q8WTV0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCARB1Q8WTV0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCARB1Q8WTV0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCARB1Q8WTV0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCARB1Q8WTV0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCARB1Q8WTV0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCARB1Q8WTV0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCARB1Q8WTV0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCARB1Q8WTV0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCARB1Q8WTV0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCARB1Q8WTV0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCARB1Q8WTV0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCARB1Q8WTV0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCARB1Q8WTV0 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.8 ms