Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBM7

TMEM254, Transmembrane protein 254, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM254Q8TBM7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM254Q8TBM7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM254Q8TBM7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM254Q8TBM7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM254Q8TBM7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM254Q8TBM7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM254Q8TBM7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM254Q8TBM7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM254Q8TBM7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM254Q8TBM7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM254Q8TBM7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM254Q8TBM7 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM254Q8TBM7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM254Q8TBM7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM254Q8TBM7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM254Q8TBM7 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM254Q8TBM7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM254Q8TBM7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM254Q8TBM7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM254Q8TBM7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM254Q8TBM7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM254Q8TBM7 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM254Q8TBM7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM254Q8TBM7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM254Q8TBM7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM254Q8TBM7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM254Q8TBM7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM254Q8TBM7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM254Q8TBM7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM254Q8TBM7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM254Q8TBM7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM254Q8TBM7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM254Q8TBM7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM254Q8TBM7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM254Q8TBM7 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM254Q8TBM7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM254Q8TBM7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM254Q8TBM7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM254Q8TBM7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM254Q8TBM7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM254Q8TBM7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM254Q8TBM7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM254Q8TBM7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM254Q8TBM7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM254Q8TBM7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM254Q8TBM7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM254Q8TBM7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM254Q8TBM7 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM254Q8TBM7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM254Q8TBM7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM254Q8TBM7 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM254Q8TBM7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM254Q8TBM7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM254Q8TBM7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM254Q8TBM7 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM254Q8TBM7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM254Q8TBM7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM254Q8TBM7 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM254Q8TBM7 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM254Q8TBM7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM254Q8TBM7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM254Q8TBM7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM254Q8TBM7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM254Q8TBM7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM254Q8TBM7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM254Q8TBM7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM254Q8TBM7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM254Q8TBM7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM254Q8TBM7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM254Q8TBM7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM254Q8TBM7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM254Q8TBM7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM254Q8TBM7 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM254Q8TBM7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM254Q8TBM7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM254Q8TBM7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM254Q8TBM7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM254Q8TBM7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM254Q8TBM7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM254Q8TBM7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM254Q8TBM7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM254Q8TBM7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM254Q8TBM7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM254Q8TBM7 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM254Q8TBM7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMEM254Q8TBM7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM254Q8TBM7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM254Q8TBM7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM254Q8TBM7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM254Q8TBM7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM254Q8TBM7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM254Q8TBM7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM254Q8TBM7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM254Q8TBM7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM254Q8TBM7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM254Q8TBM7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM254Q8TBM7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM254Q8TBM7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM254Q8TBM7 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM254Q8TBM7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms