Protein–RNA interactions for Protein: Q8N587

ZNF561, Zinc finger protein 561, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF561Q8N587 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF561Q8N587 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF561Q8N587 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF561Q8N587 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF561Q8N587 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF561Q8N587 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZNF561Q8N587 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF561Q8N587 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF561Q8N587 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF561Q8N587 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF561Q8N587 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF561Q8N587 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF561Q8N587 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF561Q8N587 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF561Q8N587 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF561Q8N587 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF561Q8N587 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF561Q8N587 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF561Q8N587 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF561Q8N587 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF561Q8N587 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF561Q8N587 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF561Q8N587 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF561Q8N587 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF561Q8N587 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF561Q8N587 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF561Q8N587 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF561Q8N587 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF561Q8N587 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF561Q8N587 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF561Q8N587 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF561Q8N587 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF561Q8N587 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF561Q8N587 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF561Q8N587 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF561Q8N587 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF561Q8N587 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF561Q8N587 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF561Q8N587 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF561Q8N587 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF561Q8N587 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF561Q8N587 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF561Q8N587 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF561Q8N587 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF561Q8N587 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF561Q8N587 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF561Q8N587 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF561Q8N587 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF561Q8N587 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF561Q8N587 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF561Q8N587 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF561Q8N587 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF561Q8N587 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF561Q8N587 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF561Q8N587 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF561Q8N587 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF561Q8N587 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF561Q8N587 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF561Q8N587 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF561Q8N587 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNF561Q8N587 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF561Q8N587 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF561Q8N587 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF561Q8N587 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF561Q8N587 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF561Q8N587 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF561Q8N587 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF561Q8N587 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF561Q8N587 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF561Q8N587 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF561Q8N587 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF561Q8N587 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF561Q8N587 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF561Q8N587 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF561Q8N587 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF561Q8N587 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF561Q8N587 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF561Q8N587 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF561Q8N587 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF561Q8N587 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF561Q8N587 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF561Q8N587 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF561Q8N587 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF561Q8N587 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF561Q8N587 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF561Q8N587 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF561Q8N587 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF561Q8N587 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF561Q8N587 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ZNF561Q8N587 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF561Q8N587 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF561Q8N587 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF561Q8N587 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF561Q8N587 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF561Q8N587 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF561Q8N587 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF561Q8N587 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF561Q8N587 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF561Q8N587 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF561Q8N587 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms