Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYT8

ULK2, Serine/threonine-protein kinase ULK2, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK2Q8IYT8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ULK2Q8IYT8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ULK2Q8IYT8 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ULK2Q8IYT8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ULK2Q8IYT8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ULK2Q8IYT8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ULK2Q8IYT8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ULK2Q8IYT8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ULK2Q8IYT8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ULK2Q8IYT8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ULK2Q8IYT8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ULK2Q8IYT8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ULK2Q8IYT8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ULK2Q8IYT8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ULK2Q8IYT8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ULK2Q8IYT8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ULK2Q8IYT8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ULK2Q8IYT8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ULK2Q8IYT8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ULK2Q8IYT8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ULK2Q8IYT8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ULK2Q8IYT8 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ULK2Q8IYT8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ULK2Q8IYT8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ULK2Q8IYT8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ULK2Q8IYT8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ULK2Q8IYT8 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ULK2Q8IYT8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ULK2Q8IYT8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ULK2Q8IYT8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ULK2Q8IYT8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ULK2Q8IYT8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ULK2Q8IYT8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ULK2Q8IYT8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ULK2Q8IYT8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ULK2Q8IYT8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ULK2Q8IYT8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ULK2Q8IYT8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ULK2Q8IYT8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ULK2Q8IYT8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ULK2Q8IYT8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ULK2Q8IYT8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ULK2Q8IYT8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ULK2Q8IYT8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ULK2Q8IYT8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ULK2Q8IYT8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ULK2Q8IYT8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ULK2Q8IYT8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ULK2Q8IYT8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ULK2Q8IYT8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ULK2Q8IYT8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ULK2Q8IYT8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ULK2Q8IYT8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ULK2Q8IYT8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ULK2Q8IYT8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ULK2Q8IYT8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ULK2Q8IYT8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ULK2Q8IYT8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ULK2Q8IYT8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ULK2Q8IYT8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ULK2Q8IYT8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ULK2Q8IYT8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ULK2Q8IYT8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ULK2Q8IYT8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ULK2Q8IYT8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ULK2Q8IYT8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ULK2Q8IYT8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ULK2Q8IYT8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ULK2Q8IYT8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ULK2Q8IYT8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ULK2Q8IYT8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ULK2Q8IYT8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ULK2Q8IYT8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ULK2Q8IYT8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ULK2Q8IYT8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ULK2Q8IYT8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ULK2Q8IYT8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ULK2Q8IYT8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ULK2Q8IYT8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ULK2Q8IYT8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ULK2Q8IYT8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ULK2Q8IYT8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ULK2Q8IYT8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ULK2Q8IYT8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ULK2Q8IYT8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ULK2Q8IYT8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ULK2Q8IYT8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ULK2Q8IYT8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ULK2Q8IYT8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ULK2Q8IYT8 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ULK2Q8IYT8 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ULK2Q8IYT8 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ULK2Q8IYT8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ULK2Q8IYT8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ULK2Q8IYT8 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ULK2Q8IYT8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ULK2Q8IYT8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ULK2Q8IYT8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ULK2Q8IYT8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ULK2Q8IYT8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 167.5 ms