Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV50

LYSMD2, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSMD2Q8IV50 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LYSMD2Q8IV50 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LYSMD2Q8IV50 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LYSMD2Q8IV50 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LYSMD2Q8IV50 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LYSMD2Q8IV50 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LYSMD2Q8IV50 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LYSMD2Q8IV50 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LYSMD2Q8IV50 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LYSMD2Q8IV50 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LYSMD2Q8IV50 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LYSMD2Q8IV50 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LYSMD2Q8IV50 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LYSMD2Q8IV50 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LYSMD2Q8IV50 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
LYSMD2Q8IV50 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LYSMD2Q8IV50 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LYSMD2Q8IV50 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LYSMD2Q8IV50 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LYSMD2Q8IV50 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LYSMD2Q8IV50 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LYSMD2Q8IV50 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LYSMD2Q8IV50 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LYSMD2Q8IV50 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LYSMD2Q8IV50 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LYSMD2Q8IV50 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LYSMD2Q8IV50 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LYSMD2Q8IV50 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LYSMD2Q8IV50 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LYSMD2Q8IV50 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LYSMD2Q8IV50 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LYSMD2Q8IV50 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LYSMD2Q8IV50 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LYSMD2Q8IV50 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LYSMD2Q8IV50 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LYSMD2Q8IV50 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LYSMD2Q8IV50 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LYSMD2Q8IV50 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LYSMD2Q8IV50 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LYSMD2Q8IV50 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LYSMD2Q8IV50 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LYSMD2Q8IV50 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LYSMD2Q8IV50 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
LYSMD2Q8IV50 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LYSMD2Q8IV50 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LYSMD2Q8IV50 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LYSMD2Q8IV50 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LYSMD2Q8IV50 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LYSMD2Q8IV50 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LYSMD2Q8IV50 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LYSMD2Q8IV50 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LYSMD2Q8IV50 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LYSMD2Q8IV50 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LYSMD2Q8IV50 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LYSMD2Q8IV50 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LYSMD2Q8IV50 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LYSMD2Q8IV50 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LYSMD2Q8IV50 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LYSMD2Q8IV50 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LYSMD2Q8IV50 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LYSMD2Q8IV50 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LYSMD2Q8IV50 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LYSMD2Q8IV50 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LYSMD2Q8IV50 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LYSMD2Q8IV50 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LYSMD2Q8IV50 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LYSMD2Q8IV50 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LYSMD2Q8IV50 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LYSMD2Q8IV50 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LYSMD2Q8IV50 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LYSMD2Q8IV50 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LYSMD2Q8IV50 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LYSMD2Q8IV50 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LYSMD2Q8IV50 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LYSMD2Q8IV50 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LYSMD2Q8IV50 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LYSMD2Q8IV50 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LYSMD2Q8IV50 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LYSMD2Q8IV50 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LYSMD2Q8IV50 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LYSMD2Q8IV50 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LYSMD2Q8IV50 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LYSMD2Q8IV50 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LYSMD2Q8IV50 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LYSMD2Q8IV50 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LYSMD2Q8IV50 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LYSMD2Q8IV50 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LYSMD2Q8IV50 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LYSMD2Q8IV50 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LYSMD2Q8IV50 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LYSMD2Q8IV50 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LYSMD2Q8IV50 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LYSMD2Q8IV50 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LYSMD2Q8IV50 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LYSMD2Q8IV50 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LYSMD2Q8IV50 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LYSMD2Q8IV50 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LYSMD2Q8IV50 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LYSMD2Q8IV50 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LYSMD2Q8IV50 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms