Protein–RNA interactions for Protein: Q86YD5

LDLRAD3, Low-density lipoprotein receptor class A domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAD3Q86YD5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LDLRAD3Q86YD5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LDLRAD3Q86YD5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LDLRAD3Q86YD5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LDLRAD3Q86YD5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LDLRAD3Q86YD5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LDLRAD3Q86YD5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LDLRAD3Q86YD5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LDLRAD3Q86YD5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LDLRAD3Q86YD5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LDLRAD3Q86YD5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LDLRAD3Q86YD5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LDLRAD3Q86YD5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LDLRAD3Q86YD5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LDLRAD3Q86YD5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LDLRAD3Q86YD5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LDLRAD3Q86YD5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LDLRAD3Q86YD5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LDLRAD3Q86YD5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LDLRAD3Q86YD5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LDLRAD3Q86YD5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LDLRAD3Q86YD5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LDLRAD3Q86YD5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LDLRAD3Q86YD5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LDLRAD3Q86YD5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LDLRAD3Q86YD5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LDLRAD3Q86YD5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LDLRAD3Q86YD5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LDLRAD3Q86YD5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LDLRAD3Q86YD5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LDLRAD3Q86YD5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LDLRAD3Q86YD5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LDLRAD3Q86YD5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LDLRAD3Q86YD5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LDLRAD3Q86YD5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LDLRAD3Q86YD5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LDLRAD3Q86YD5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LDLRAD3Q86YD5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LDLRAD3Q86YD5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LDLRAD3Q86YD5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LDLRAD3Q86YD5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LDLRAD3Q86YD5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LDLRAD3Q86YD5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LDLRAD3Q86YD5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LDLRAD3Q86YD5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LDLRAD3Q86YD5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LDLRAD3Q86YD5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LDLRAD3Q86YD5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LDLRAD3Q86YD5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LDLRAD3Q86YD5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LDLRAD3Q86YD5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LDLRAD3Q86YD5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDLRAD3Q86YD5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LDLRAD3Q86YD5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LDLRAD3Q86YD5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LDLRAD3Q86YD5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LDLRAD3Q86YD5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LDLRAD3Q86YD5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LDLRAD3Q86YD5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LDLRAD3Q86YD5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LDLRAD3Q86YD5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LDLRAD3Q86YD5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LDLRAD3Q86YD5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LDLRAD3Q86YD5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LDLRAD3Q86YD5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LDLRAD3Q86YD5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LDLRAD3Q86YD5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LDLRAD3Q86YD5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LDLRAD3Q86YD5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LDLRAD3Q86YD5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LDLRAD3Q86YD5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LDLRAD3Q86YD5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LDLRAD3Q86YD5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LDLRAD3Q86YD5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LDLRAD3Q86YD5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LDLRAD3Q86YD5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LDLRAD3Q86YD5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LDLRAD3Q86YD5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LDLRAD3Q86YD5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LDLRAD3Q86YD5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LDLRAD3Q86YD5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LDLRAD3Q86YD5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LDLRAD3Q86YD5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LDLRAD3Q86YD5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LDLRAD3Q86YD5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LDLRAD3Q86YD5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LDLRAD3Q86YD5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LDLRAD3Q86YD5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LDLRAD3Q86YD5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LDLRAD3Q86YD5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LDLRAD3Q86YD5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LDLRAD3Q86YD5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LDLRAD3Q86YD5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LDLRAD3Q86YD5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LDLRAD3Q86YD5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LDLRAD3Q86YD5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LDLRAD3Q86YD5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LDLRAD3Q86YD5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LDLRAD3Q86YD5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LDLRAD3Q86YD5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms