Protein–RNA interactions for Protein: Q86X55

CARM1, Histone-arginine methyltransferase CARM1, humanhuman

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARM1Q86X55 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CARM1Q86X55 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CARM1Q86X55 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CARM1Q86X55 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CARM1Q86X55 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CARM1Q86X55 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CARM1Q86X55 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CARM1Q86X55 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CARM1Q86X55 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CARM1Q86X55 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CARM1Q86X55 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CARM1Q86X55 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CARM1Q86X55 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CARM1Q86X55 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CARM1Q86X55 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CARM1Q86X55 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CARM1Q86X55 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CARM1Q86X55 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CARM1Q86X55 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CARM1Q86X55 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CARM1Q86X55 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CARM1Q86X55 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CARM1Q86X55 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CARM1Q86X55 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CARM1Q86X55 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CARM1Q86X55 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CARM1Q86X55 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CARM1Q86X55 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CARM1Q86X55 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CARM1Q86X55 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CARM1Q86X55 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CARM1Q86X55 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CARM1Q86X55 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CARM1Q86X55 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CARM1Q86X55 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CARM1Q86X55 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CARM1Q86X55 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CARM1Q86X55 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CARM1Q86X55 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CARM1Q86X55 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CARM1Q86X55 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CARM1Q86X55 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CARM1Q86X55 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CARM1Q86X55 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CARM1Q86X55 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CARM1Q86X55 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CARM1Q86X55 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CARM1Q86X55 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CARM1Q86X55 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CARM1Q86X55 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CARM1Q86X55 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CARM1Q86X55 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CARM1Q86X55 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CARM1Q86X55 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CARM1Q86X55 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CARM1Q86X55 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CARM1Q86X55 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CARM1Q86X55 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CARM1Q86X55 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CARM1Q86X55 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CARM1Q86X55 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CARM1Q86X55 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CARM1Q86X55 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CARM1Q86X55 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CARM1Q86X55 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CARM1Q86X55 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CARM1Q86X55 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CARM1Q86X55 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CARM1Q86X55 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CARM1Q86X55 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CARM1Q86X55 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CARM1Q86X55 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CARM1Q86X55 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CARM1Q86X55 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CARM1Q86X55 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CARM1Q86X55 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CARM1Q86X55 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CARM1Q86X55 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CARM1Q86X55 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CARM1Q86X55 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CARM1Q86X55 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CARM1Q86X55 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CARM1Q86X55 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CARM1Q86X55 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CARM1Q86X55 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CARM1Q86X55 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CARM1Q86X55 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CARM1Q86X55 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CARM1Q86X55 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CARM1Q86X55 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CARM1Q86X55 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CARM1Q86X55 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CARM1Q86X55 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CARM1Q86X55 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CARM1Q86X55 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CARM1Q86X55 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CARM1Q86X55 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CARM1Q86X55 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CARM1Q86X55 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CARM1Q86X55 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms