Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y8

KRT27, Keratin, type I cytoskeletal 27, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT27Q7Z3Y8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC36.84■■■■□ 3.49
KRT27Q7Z3Y8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
KRT27Q7Z3Y8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC36.82■■■■□ 3.48
KRT27Q7Z3Y8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
KRT27Q7Z3Y8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC36.81■■■■□ 3.48
KRT27Q7Z3Y8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
KRT27Q7Z3Y8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
KRT27Q7Z3Y8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
KRT27Q7Z3Y8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
KRT27Q7Z3Y8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
KRT27Q7Z3Y8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
KRT27Q7Z3Y8 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
KRT27Q7Z3Y8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
KRT27Q7Z3Y8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
KRT27Q7Z3Y8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
KRT27Q7Z3Y8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
KRT27Q7Z3Y8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
KRT27Q7Z3Y8 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
KRT27Q7Z3Y8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
KRT27Q7Z3Y8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
KRT27Q7Z3Y8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
KRT27Q7Z3Y8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
KRT27Q7Z3Y8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC36.61■■■■□ 3.45
KRT27Q7Z3Y8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
KRT27Q7Z3Y8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
KRT27Q7Z3Y8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC36.6■■■■□ 3.45
KRT27Q7Z3Y8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC36.58■■■■□ 3.45
KRT27Q7Z3Y8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
KRT27Q7Z3Y8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.55■■■■□ 3.44
KRT27Q7Z3Y8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
KRT27Q7Z3Y8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
KRT27Q7Z3Y8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
KRT27Q7Z3Y8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
KRT27Q7Z3Y8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
KRT27Q7Z3Y8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
KRT27Q7Z3Y8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
KRT27Q7Z3Y8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC36.46■■■■□ 3.43
KRT27Q7Z3Y8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
KRT27Q7Z3Y8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
KRT27Q7Z3Y8 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
KRT27Q7Z3Y8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
KRT27Q7Z3Y8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
KRT27Q7Z3Y8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
KRT27Q7Z3Y8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
KRT27Q7Z3Y8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
KRT27Q7Z3Y8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
KRT27Q7Z3Y8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
KRT27Q7Z3Y8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC36.38■■■■□ 3.41
KRT27Q7Z3Y8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
KRT27Q7Z3Y8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
KRT27Q7Z3Y8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
KRT27Q7Z3Y8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
KRT27Q7Z3Y8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
KRT27Q7Z3Y8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC36.33■■■■□ 3.41
KRT27Q7Z3Y8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC36.33■■■■□ 3.41
KRT27Q7Z3Y8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
KRT27Q7Z3Y8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC36.31■■■■□ 3.4
KRT27Q7Z3Y8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
KRT27Q7Z3Y8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
KRT27Q7Z3Y8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
KRT27Q7Z3Y8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
KRT27Q7Z3Y8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
KRT27Q7Z3Y8 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
KRT27Q7Z3Y8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
KRT27Q7Z3Y8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
KRT27Q7Z3Y8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC36.28■■■■□ 3.4
KRT27Q7Z3Y8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
KRT27Q7Z3Y8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
KRT27Q7Z3Y8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
KRT27Q7Z3Y8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
KRT27Q7Z3Y8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
KRT27Q7Z3Y8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
KRT27Q7Z3Y8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
KRT27Q7Z3Y8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
KRT27Q7Z3Y8 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
KRT27Q7Z3Y8 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
KRT27Q7Z3Y8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
KRT27Q7Z3Y8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
KRT27Q7Z3Y8 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
KRT27Q7Z3Y8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
KRT27Q7Z3Y8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
KRT27Q7Z3Y8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
KRT27Q7Z3Y8 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
KRT27Q7Z3Y8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
KRT27Q7Z3Y8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
KRT27Q7Z3Y8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
KRT27Q7Z3Y8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
KRT27Q7Z3Y8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
KRT27Q7Z3Y8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
KRT27Q7Z3Y8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
KRT27Q7Z3Y8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
KRT27Q7Z3Y8 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
KRT27Q7Z3Y8 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
KRT27Q7Z3Y8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
KRT27Q7Z3Y8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
KRT27Q7Z3Y8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
KRT27Q7Z3Y8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
KRT27Q7Z3Y8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
KRT27Q7Z3Y8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
KRT27Q7Z3Y8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms