Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5L3

GDPD3, Lysophospholipase D GDPD3, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD3Q7L5L3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GDPD3Q7L5L3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GDPD3Q7L5L3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GDPD3Q7L5L3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GDPD3Q7L5L3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GDPD3Q7L5L3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GDPD3Q7L5L3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
GDPD3Q7L5L3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GDPD3Q7L5L3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GDPD3Q7L5L3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GDPD3Q7L5L3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GDPD3Q7L5L3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GDPD3Q7L5L3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GDPD3Q7L5L3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GDPD3Q7L5L3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GDPD3Q7L5L3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GDPD3Q7L5L3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GDPD3Q7L5L3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GDPD3Q7L5L3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GDPD3Q7L5L3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GDPD3Q7L5L3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GDPD3Q7L5L3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GDPD3Q7L5L3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GDPD3Q7L5L3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GDPD3Q7L5L3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GDPD3Q7L5L3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GDPD3Q7L5L3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GDPD3Q7L5L3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GDPD3Q7L5L3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GDPD3Q7L5L3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GDPD3Q7L5L3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GDPD3Q7L5L3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GDPD3Q7L5L3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GDPD3Q7L5L3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GDPD3Q7L5L3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GDPD3Q7L5L3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GDPD3Q7L5L3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GDPD3Q7L5L3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GDPD3Q7L5L3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GDPD3Q7L5L3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GDPD3Q7L5L3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GDPD3Q7L5L3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GDPD3Q7L5L3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GDPD3Q7L5L3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GDPD3Q7L5L3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GDPD3Q7L5L3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GDPD3Q7L5L3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GDPD3Q7L5L3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GDPD3Q7L5L3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GDPD3Q7L5L3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GDPD3Q7L5L3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GDPD3Q7L5L3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GDPD3Q7L5L3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GDPD3Q7L5L3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GDPD3Q7L5L3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GDPD3Q7L5L3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GDPD3Q7L5L3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GDPD3Q7L5L3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GDPD3Q7L5L3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GDPD3Q7L5L3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GDPD3Q7L5L3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GDPD3Q7L5L3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GDPD3Q7L5L3 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GDPD3Q7L5L3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GDPD3Q7L5L3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GDPD3Q7L5L3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GDPD3Q7L5L3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GDPD3Q7L5L3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GDPD3Q7L5L3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GDPD3Q7L5L3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GDPD3Q7L5L3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GDPD3Q7L5L3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
GDPD3Q7L5L3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GDPD3Q7L5L3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GDPD3Q7L5L3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GDPD3Q7L5L3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GDPD3Q7L5L3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GDPD3Q7L5L3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GDPD3Q7L5L3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GDPD3Q7L5L3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GDPD3Q7L5L3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GDPD3Q7L5L3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GDPD3Q7L5L3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GDPD3Q7L5L3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GDPD3Q7L5L3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GDPD3Q7L5L3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GDPD3Q7L5L3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GDPD3Q7L5L3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GDPD3Q7L5L3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GDPD3Q7L5L3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GDPD3Q7L5L3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GDPD3Q7L5L3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GDPD3Q7L5L3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GDPD3Q7L5L3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GDPD3Q7L5L3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GDPD3Q7L5L3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GDPD3Q7L5L3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GDPD3Q7L5L3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GDPD3Q7L5L3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GDPD3Q7L5L3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms