Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXD1

HRCT1, Histidine-rich carboxyl terminus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCT1Q6UXD1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HRCT1Q6UXD1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HRCT1Q6UXD1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HRCT1Q6UXD1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HRCT1Q6UXD1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HRCT1Q6UXD1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HRCT1Q6UXD1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HRCT1Q6UXD1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HRCT1Q6UXD1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HRCT1Q6UXD1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HRCT1Q6UXD1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HRCT1Q6UXD1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HRCT1Q6UXD1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HRCT1Q6UXD1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HRCT1Q6UXD1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HRCT1Q6UXD1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HRCT1Q6UXD1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HRCT1Q6UXD1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HRCT1Q6UXD1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HRCT1Q6UXD1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HRCT1Q6UXD1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HRCT1Q6UXD1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HRCT1Q6UXD1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HRCT1Q6UXD1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HRCT1Q6UXD1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HRCT1Q6UXD1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HRCT1Q6UXD1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HRCT1Q6UXD1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HRCT1Q6UXD1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HRCT1Q6UXD1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HRCT1Q6UXD1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HRCT1Q6UXD1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HRCT1Q6UXD1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HRCT1Q6UXD1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HRCT1Q6UXD1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HRCT1Q6UXD1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HRCT1Q6UXD1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HRCT1Q6UXD1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HRCT1Q6UXD1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HRCT1Q6UXD1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HRCT1Q6UXD1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HRCT1Q6UXD1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HRCT1Q6UXD1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HRCT1Q6UXD1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HRCT1Q6UXD1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HRCT1Q6UXD1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HRCT1Q6UXD1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HRCT1Q6UXD1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HRCT1Q6UXD1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HRCT1Q6UXD1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HRCT1Q6UXD1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HRCT1Q6UXD1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HRCT1Q6UXD1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HRCT1Q6UXD1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HRCT1Q6UXD1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HRCT1Q6UXD1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HRCT1Q6UXD1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HRCT1Q6UXD1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HRCT1Q6UXD1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HRCT1Q6UXD1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HRCT1Q6UXD1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HRCT1Q6UXD1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HRCT1Q6UXD1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HRCT1Q6UXD1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HRCT1Q6UXD1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HRCT1Q6UXD1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HRCT1Q6UXD1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HRCT1Q6UXD1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HRCT1Q6UXD1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HRCT1Q6UXD1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HRCT1Q6UXD1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HRCT1Q6UXD1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HRCT1Q6UXD1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HRCT1Q6UXD1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HRCT1Q6UXD1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HRCT1Q6UXD1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HRCT1Q6UXD1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HRCT1Q6UXD1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HRCT1Q6UXD1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HRCT1Q6UXD1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HRCT1Q6UXD1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HRCT1Q6UXD1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HRCT1Q6UXD1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HRCT1Q6UXD1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HRCT1Q6UXD1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HRCT1Q6UXD1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
HRCT1Q6UXD1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HRCT1Q6UXD1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HRCT1Q6UXD1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HRCT1Q6UXD1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HRCT1Q6UXD1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HRCT1Q6UXD1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HRCT1Q6UXD1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HRCT1Q6UXD1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HRCT1Q6UXD1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HRCT1Q6UXD1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HRCT1Q6UXD1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HRCT1Q6UXD1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HRCT1Q6UXD1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HRCT1Q6UXD1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.6 ms