Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW10

SFTA2, Surfactant-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA2Q6UW10 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SFTA2Q6UW10 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SFTA2Q6UW10 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SFTA2Q6UW10 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SFTA2Q6UW10 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SFTA2Q6UW10 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SFTA2Q6UW10 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SFTA2Q6UW10 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFTA2Q6UW10 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFTA2Q6UW10 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFTA2Q6UW10 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SFTA2Q6UW10 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SFTA2Q6UW10 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SFTA2Q6UW10 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SFTA2Q6UW10 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SFTA2Q6UW10 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SFTA2Q6UW10 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SFTA2Q6UW10 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SFTA2Q6UW10 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SFTA2Q6UW10 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SFTA2Q6UW10 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SFTA2Q6UW10 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SFTA2Q6UW10 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SFTA2Q6UW10 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SFTA2Q6UW10 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFTA2Q6UW10 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFTA2Q6UW10 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFTA2Q6UW10 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFTA2Q6UW10 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFTA2Q6UW10 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFTA2Q6UW10 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFTA2Q6UW10 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFTA2Q6UW10 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFTA2Q6UW10 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFTA2Q6UW10 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFTA2Q6UW10 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFTA2Q6UW10 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SFTA2Q6UW10 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SFTA2Q6UW10 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SFTA2Q6UW10 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFTA2Q6UW10 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFTA2Q6UW10 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFTA2Q6UW10 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFTA2Q6UW10 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFTA2Q6UW10 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFTA2Q6UW10 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFTA2Q6UW10 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFTA2Q6UW10 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFTA2Q6UW10 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFTA2Q6UW10 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFTA2Q6UW10 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFTA2Q6UW10 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SFTA2Q6UW10 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SFTA2Q6UW10 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFTA2Q6UW10 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFTA2Q6UW10 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SFTA2Q6UW10 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SFTA2Q6UW10 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFTA2Q6UW10 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFTA2Q6UW10 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFTA2Q6UW10 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFTA2Q6UW10 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFTA2Q6UW10 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFTA2Q6UW10 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFTA2Q6UW10 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFTA2Q6UW10 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFTA2Q6UW10 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFTA2Q6UW10 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFTA2Q6UW10 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFTA2Q6UW10 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFTA2Q6UW10 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFTA2Q6UW10 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFTA2Q6UW10 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFTA2Q6UW10 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFTA2Q6UW10 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFTA2Q6UW10 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFTA2Q6UW10 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SFTA2Q6UW10 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFTA2Q6UW10 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFTA2Q6UW10 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFTA2Q6UW10 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFTA2Q6UW10 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFTA2Q6UW10 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFTA2Q6UW10 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFTA2Q6UW10 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFTA2Q6UW10 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFTA2Q6UW10 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFTA2Q6UW10 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFTA2Q6UW10 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFTA2Q6UW10 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFTA2Q6UW10 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFTA2Q6UW10 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFTA2Q6UW10 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SFTA2Q6UW10 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SFTA2Q6UW10 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SFTA2Q6UW10 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SFTA2Q6UW10 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFTA2Q6UW10 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFTA2Q6UW10 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFTA2Q6UW10 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.6 ms