Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIL6

KCNIP4, Kv channel-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP4Q6PIL6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNIP4Q6PIL6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNIP4Q6PIL6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNIP4Q6PIL6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNIP4Q6PIL6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNIP4Q6PIL6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCNIP4Q6PIL6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCNIP4Q6PIL6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KCNIP4Q6PIL6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
KCNIP4Q6PIL6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
KCNIP4Q6PIL6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KCNIP4Q6PIL6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCNIP4Q6PIL6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCNIP4Q6PIL6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCNIP4Q6PIL6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCNIP4Q6PIL6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCNIP4Q6PIL6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCNIP4Q6PIL6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KCNIP4Q6PIL6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KCNIP4Q6PIL6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KCNIP4Q6PIL6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KCNIP4Q6PIL6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KCNIP4Q6PIL6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KCNIP4Q6PIL6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KCNIP4Q6PIL6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KCNIP4Q6PIL6 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KCNIP4Q6PIL6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KCNIP4Q6PIL6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KCNIP4Q6PIL6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNIP4Q6PIL6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNIP4Q6PIL6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNIP4Q6PIL6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNIP4Q6PIL6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KCNIP4Q6PIL6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCNIP4Q6PIL6 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCNIP4Q6PIL6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCNIP4Q6PIL6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCNIP4Q6PIL6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCNIP4Q6PIL6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCNIP4Q6PIL6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCNIP4Q6PIL6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCNIP4Q6PIL6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCNIP4Q6PIL6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCNIP4Q6PIL6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCNIP4Q6PIL6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCNIP4Q6PIL6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCNIP4Q6PIL6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCNIP4Q6PIL6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCNIP4Q6PIL6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCNIP4Q6PIL6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCNIP4Q6PIL6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
KCNIP4Q6PIL6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNIP4Q6PIL6 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNIP4Q6PIL6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNIP4Q6PIL6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNIP4Q6PIL6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNIP4Q6PIL6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNIP4Q6PIL6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNIP4Q6PIL6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KCNIP4Q6PIL6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KCNIP4Q6PIL6 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KCNIP4Q6PIL6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KCNIP4Q6PIL6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCNIP4Q6PIL6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCNIP4Q6PIL6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCNIP4Q6PIL6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNIP4Q6PIL6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNIP4Q6PIL6 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNIP4Q6PIL6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNIP4Q6PIL6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNIP4Q6PIL6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNIP4Q6PIL6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNIP4Q6PIL6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNIP4Q6PIL6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KCNIP4Q6PIL6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KCNIP4Q6PIL6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KCNIP4Q6PIL6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KCNIP4Q6PIL6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KCNIP4Q6PIL6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
KCNIP4Q6PIL6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KCNIP4Q6PIL6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KCNIP4Q6PIL6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
KCNIP4Q6PIL6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KCNIP4Q6PIL6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KCNIP4Q6PIL6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
KCNIP4Q6PIL6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KCNIP4Q6PIL6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KCNIP4Q6PIL6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KCNIP4Q6PIL6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KCNIP4Q6PIL6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
KCNIP4Q6PIL6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KCNIP4Q6PIL6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KCNIP4Q6PIL6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KCNIP4Q6PIL6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
KCNIP4Q6PIL6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KCNIP4Q6PIL6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
KCNIP4Q6PIL6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
KCNIP4Q6PIL6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KCNIP4Q6PIL6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KCNIP4Q6PIL6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.3 ms