Protein–RNA interactions for Protein: Q6PI97

C11orf88, UPF0722 protein C11orf88, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf88Q6PI97 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C11orf88Q6PI97 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C11orf88Q6PI97 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C11orf88Q6PI97 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C11orf88Q6PI97 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C11orf88Q6PI97 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C11orf88Q6PI97 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C11orf88Q6PI97 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C11orf88Q6PI97 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C11orf88Q6PI97 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C11orf88Q6PI97 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C11orf88Q6PI97 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C11orf88Q6PI97 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C11orf88Q6PI97 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C11orf88Q6PI97 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C11orf88Q6PI97 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C11orf88Q6PI97 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C11orf88Q6PI97 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C11orf88Q6PI97 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C11orf88Q6PI97 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C11orf88Q6PI97 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C11orf88Q6PI97 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C11orf88Q6PI97 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C11orf88Q6PI97 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C11orf88Q6PI97 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C11orf88Q6PI97 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C11orf88Q6PI97 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C11orf88Q6PI97 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C11orf88Q6PI97 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C11orf88Q6PI97 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C11orf88Q6PI97 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C11orf88Q6PI97 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C11orf88Q6PI97 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C11orf88Q6PI97 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
C11orf88Q6PI97 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C11orf88Q6PI97 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C11orf88Q6PI97 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C11orf88Q6PI97 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C11orf88Q6PI97 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C11orf88Q6PI97 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C11orf88Q6PI97 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
C11orf88Q6PI97 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C11orf88Q6PI97 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C11orf88Q6PI97 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C11orf88Q6PI97 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C11orf88Q6PI97 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C11orf88Q6PI97 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
C11orf88Q6PI97 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C11orf88Q6PI97 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C11orf88Q6PI97 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C11orf88Q6PI97 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C11orf88Q6PI97 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C11orf88Q6PI97 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C11orf88Q6PI97 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C11orf88Q6PI97 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C11orf88Q6PI97 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
C11orf88Q6PI97 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C11orf88Q6PI97 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C11orf88Q6PI97 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C11orf88Q6PI97 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C11orf88Q6PI97 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C11orf88Q6PI97 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C11orf88Q6PI97 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C11orf88Q6PI97 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C11orf88Q6PI97 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C11orf88Q6PI97 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C11orf88Q6PI97 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C11orf88Q6PI97 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C11orf88Q6PI97 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C11orf88Q6PI97 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C11orf88Q6PI97 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C11orf88Q6PI97 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C11orf88Q6PI97 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C11orf88Q6PI97 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C11orf88Q6PI97 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C11orf88Q6PI97 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C11orf88Q6PI97 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C11orf88Q6PI97 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C11orf88Q6PI97 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C11orf88Q6PI97 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C11orf88Q6PI97 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C11orf88Q6PI97 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C11orf88Q6PI97 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C11orf88Q6PI97 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C11orf88Q6PI97 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C11orf88Q6PI97 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C11orf88Q6PI97 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
C11orf88Q6PI97 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C11orf88Q6PI97 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C11orf88Q6PI97 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C11orf88Q6PI97 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C11orf88Q6PI97 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C11orf88Q6PI97 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C11orf88Q6PI97 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
C11orf88Q6PI97 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C11orf88Q6PI97 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C11orf88Q6PI97 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C11orf88Q6PI97 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C11orf88Q6PI97 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C11orf88Q6PI97 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms