Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4A7

SFXN4, Sideroflexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFXN4Q6P4A7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SFXN4Q6P4A7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SFXN4Q6P4A7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SFXN4Q6P4A7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SFXN4Q6P4A7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SFXN4Q6P4A7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SFXN4Q6P4A7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SFXN4Q6P4A7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SFXN4Q6P4A7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SFXN4Q6P4A7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SFXN4Q6P4A7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SFXN4Q6P4A7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SFXN4Q6P4A7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SFXN4Q6P4A7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SFXN4Q6P4A7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SFXN4Q6P4A7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SFXN4Q6P4A7 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SFXN4Q6P4A7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SFXN4Q6P4A7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SFXN4Q6P4A7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SFXN4Q6P4A7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SFXN4Q6P4A7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SFXN4Q6P4A7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SFXN4Q6P4A7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SFXN4Q6P4A7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SFXN4Q6P4A7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SFXN4Q6P4A7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SFXN4Q6P4A7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SFXN4Q6P4A7 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SFXN4Q6P4A7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SFXN4Q6P4A7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SFXN4Q6P4A7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SFXN4Q6P4A7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SFXN4Q6P4A7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SFXN4Q6P4A7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SFXN4Q6P4A7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SFXN4Q6P4A7 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SFXN4Q6P4A7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SFXN4Q6P4A7 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SFXN4Q6P4A7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SFXN4Q6P4A7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SFXN4Q6P4A7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SFXN4Q6P4A7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SFXN4Q6P4A7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
SFXN4Q6P4A7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SFXN4Q6P4A7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SFXN4Q6P4A7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SFXN4Q6P4A7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SFXN4Q6P4A7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SFXN4Q6P4A7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SFXN4Q6P4A7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SFXN4Q6P4A7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SFXN4Q6P4A7 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SFXN4Q6P4A7 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SFXN4Q6P4A7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SFXN4Q6P4A7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SFXN4Q6P4A7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SFXN4Q6P4A7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SFXN4Q6P4A7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SFXN4Q6P4A7 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SFXN4Q6P4A7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SFXN4Q6P4A7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SFXN4Q6P4A7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SFXN4Q6P4A7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SFXN4Q6P4A7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SFXN4Q6P4A7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SFXN4Q6P4A7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SFXN4Q6P4A7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SFXN4Q6P4A7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SFXN4Q6P4A7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SFXN4Q6P4A7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SFXN4Q6P4A7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SFXN4Q6P4A7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SFXN4Q6P4A7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SFXN4Q6P4A7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SFXN4Q6P4A7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SFXN4Q6P4A7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SFXN4Q6P4A7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SFXN4Q6P4A7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SFXN4Q6P4A7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SFXN4Q6P4A7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SFXN4Q6P4A7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SFXN4Q6P4A7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SFXN4Q6P4A7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SFXN4Q6P4A7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SFXN4Q6P4A7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SFXN4Q6P4A7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SFXN4Q6P4A7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SFXN4Q6P4A7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SFXN4Q6P4A7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SFXN4Q6P4A7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SFXN4Q6P4A7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SFXN4Q6P4A7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SFXN4Q6P4A7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SFXN4Q6P4A7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SFXN4Q6P4A7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SFXN4Q6P4A7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SFXN4Q6P4A7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SFXN4Q6P4A7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SFXN4Q6P4A7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms