Protein–RNA interactions for Protein: Q6IA17

SIGIRR, Single Ig IL-1-related receptor, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIGIRRQ6IA17 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIGIRRQ6IA17 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIGIRRQ6IA17 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIGIRRQ6IA17 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIGIRRQ6IA17 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIGIRRQ6IA17 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIGIRRQ6IA17 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIGIRRQ6IA17 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIGIRRQ6IA17 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIGIRRQ6IA17 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SIGIRRQ6IA17 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIGIRRQ6IA17 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIGIRRQ6IA17 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIGIRRQ6IA17 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIGIRRQ6IA17 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIGIRRQ6IA17 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIGIRRQ6IA17 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIGIRRQ6IA17 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIGIRRQ6IA17 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIGIRRQ6IA17 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SIGIRRQ6IA17 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIGIRRQ6IA17 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIGIRRQ6IA17 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIGIRRQ6IA17 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIGIRRQ6IA17 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIGIRRQ6IA17 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIGIRRQ6IA17 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIGIRRQ6IA17 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIGIRRQ6IA17 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIGIRRQ6IA17 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIGIRRQ6IA17 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIGIRRQ6IA17 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIGIRRQ6IA17 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIGIRRQ6IA17 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIGIRRQ6IA17 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIGIRRQ6IA17 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIGIRRQ6IA17 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIGIRRQ6IA17 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIGIRRQ6IA17 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIGIRRQ6IA17 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIGIRRQ6IA17 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIGIRRQ6IA17 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIGIRRQ6IA17 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIGIRRQ6IA17 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIGIRRQ6IA17 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIGIRRQ6IA17 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIGIRRQ6IA17 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIGIRRQ6IA17 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIGIRRQ6IA17 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIGIRRQ6IA17 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIGIRRQ6IA17 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIGIRRQ6IA17 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIGIRRQ6IA17 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIGIRRQ6IA17 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIGIRRQ6IA17 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
SIGIRRQ6IA17 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SIGIRRQ6IA17 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SIGIRRQ6IA17 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIGIRRQ6IA17 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIGIRRQ6IA17 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIGIRRQ6IA17 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIGIRRQ6IA17 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIGIRRQ6IA17 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIGIRRQ6IA17 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIGIRRQ6IA17 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SIGIRRQ6IA17 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIGIRRQ6IA17 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SIGIRRQ6IA17 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SIGIRRQ6IA17 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIGIRRQ6IA17 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIGIRRQ6IA17 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIGIRRQ6IA17 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIGIRRQ6IA17 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIGIRRQ6IA17 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIGIRRQ6IA17 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIGIRRQ6IA17 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIGIRRQ6IA17 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIGIRRQ6IA17 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIGIRRQ6IA17 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIGIRRQ6IA17 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIGIRRQ6IA17 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SIGIRRQ6IA17 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIGIRRQ6IA17 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIGIRRQ6IA17 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIGIRRQ6IA17 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIGIRRQ6IA17 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIGIRRQ6IA17 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIGIRRQ6IA17 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIGIRRQ6IA17 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIGIRRQ6IA17 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIGIRRQ6IA17 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIGIRRQ6IA17 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIGIRRQ6IA17 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SIGIRRQ6IA17 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIGIRRQ6IA17 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIGIRRQ6IA17 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIGIRRQ6IA17 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIGIRRQ6IA17 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIGIRRQ6IA17 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIGIRRQ6IA17 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.2 ms