Protein–RNA interactions for Protein: Q6IA17

SIGIRR, Single Ig IL-1-related receptor, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIGIRRQ6IA17 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIGIRRQ6IA17 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIGIRRQ6IA17 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIGIRRQ6IA17 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIGIRRQ6IA17 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIGIRRQ6IA17 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIGIRRQ6IA17 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIGIRRQ6IA17 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIGIRRQ6IA17 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIGIRRQ6IA17 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SIGIRRQ6IA17 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIGIRRQ6IA17 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIGIRRQ6IA17 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIGIRRQ6IA17 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIGIRRQ6IA17 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIGIRRQ6IA17 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIGIRRQ6IA17 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIGIRRQ6IA17 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIGIRRQ6IA17 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIGIRRQ6IA17 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SIGIRRQ6IA17 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIGIRRQ6IA17 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIGIRRQ6IA17 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIGIRRQ6IA17 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIGIRRQ6IA17 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIGIRRQ6IA17 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIGIRRQ6IA17 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIGIRRQ6IA17 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIGIRRQ6IA17 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIGIRRQ6IA17 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIGIRRQ6IA17 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIGIRRQ6IA17 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIGIRRQ6IA17 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIGIRRQ6IA17 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIGIRRQ6IA17 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIGIRRQ6IA17 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIGIRRQ6IA17 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIGIRRQ6IA17 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIGIRRQ6IA17 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIGIRRQ6IA17 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIGIRRQ6IA17 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIGIRRQ6IA17 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIGIRRQ6IA17 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIGIRRQ6IA17 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIGIRRQ6IA17 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIGIRRQ6IA17 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIGIRRQ6IA17 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIGIRRQ6IA17 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIGIRRQ6IA17 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIGIRRQ6IA17 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIGIRRQ6IA17 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIGIRRQ6IA17 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIGIRRQ6IA17 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIGIRRQ6IA17 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIGIRRQ6IA17 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
SIGIRRQ6IA17 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SIGIRRQ6IA17 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SIGIRRQ6IA17 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIGIRRQ6IA17 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIGIRRQ6IA17 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIGIRRQ6IA17 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIGIRRQ6IA17 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIGIRRQ6IA17 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIGIRRQ6IA17 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIGIRRQ6IA17 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SIGIRRQ6IA17 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIGIRRQ6IA17 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SIGIRRQ6IA17 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SIGIRRQ6IA17 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIGIRRQ6IA17 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIGIRRQ6IA17 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIGIRRQ6IA17 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIGIRRQ6IA17 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIGIRRQ6IA17 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIGIRRQ6IA17 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIGIRRQ6IA17 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIGIRRQ6IA17 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIGIRRQ6IA17 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIGIRRQ6IA17 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIGIRRQ6IA17 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIGIRRQ6IA17 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SIGIRRQ6IA17 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIGIRRQ6IA17 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIGIRRQ6IA17 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIGIRRQ6IA17 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIGIRRQ6IA17 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIGIRRQ6IA17 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIGIRRQ6IA17 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIGIRRQ6IA17 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIGIRRQ6IA17 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIGIRRQ6IA17 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIGIRRQ6IA17 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIGIRRQ6IA17 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SIGIRRQ6IA17 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIGIRRQ6IA17 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIGIRRQ6IA17 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIGIRRQ6IA17 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIGIRRQ6IA17 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIGIRRQ6IA17 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIGIRRQ6IA17 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms