Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LINC01545Q5VT33 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LINC01545Q5VT33 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LINC01545Q5VT33 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LINC01545Q5VT33 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LINC01545Q5VT33 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LINC01545Q5VT33 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LINC01545Q5VT33 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LINC01545Q5VT33 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LINC01545Q5VT33 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LINC01545Q5VT33 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LINC01545Q5VT33 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LINC01545Q5VT33 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LINC01545Q5VT33 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LINC01545Q5VT33 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LINC01545Q5VT33 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LINC01545Q5VT33 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
LINC01545Q5VT33 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
LINC01545Q5VT33 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC01545Q5VT33 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC01545Q5VT33 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LINC01545Q5VT33 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LINC01545Q5VT33 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LINC01545Q5VT33 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LINC01545Q5VT33 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LINC01545Q5VT33 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LINC01545Q5VT33 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LINC01545Q5VT33 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
LINC01545Q5VT33 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LINC01545Q5VT33 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LINC01545Q5VT33 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
LINC01545Q5VT33 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LINC01545Q5VT33 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LINC01545Q5VT33 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LINC01545Q5VT33 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LINC01545Q5VT33 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LINC01545Q5VT33 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LINC01545Q5VT33 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LINC01545Q5VT33 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LINC01545Q5VT33 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LINC01545Q5VT33 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LINC01545Q5VT33 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LINC01545Q5VT33 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
LINC01545Q5VT33 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LINC01545Q5VT33 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LINC01545Q5VT33 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LINC01545Q5VT33 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LINC01545Q5VT33 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LINC01545Q5VT33 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LINC01545Q5VT33 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
LINC01545Q5VT33 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LINC01545Q5VT33 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LINC01545Q5VT33 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LINC01545Q5VT33 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LINC01545Q5VT33 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
LINC01545Q5VT33 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
LINC01545Q5VT33 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LINC01545Q5VT33 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LINC01545Q5VT33 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LINC01545Q5VT33 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LINC01545Q5VT33 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LINC01545Q5VT33 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LINC01545Q5VT33 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LINC01545Q5VT33 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LINC01545Q5VT33 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LINC01545Q5VT33 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LINC01545Q5VT33 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LINC01545Q5VT33 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LINC01545Q5VT33 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LINC01545Q5VT33 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LINC01545Q5VT33 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LINC01545Q5VT33 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LINC01545Q5VT33 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC01545Q5VT33 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC01545Q5VT33 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC01545Q5VT33 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC01545Q5VT33 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LINC01545Q5VT33 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LINC01545Q5VT33 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LINC01545Q5VT33 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LINC01545Q5VT33 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LINC01545Q5VT33 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC01545Q5VT33 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC01545Q5VT33 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC01545Q5VT33 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC01545Q5VT33 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LINC01545Q5VT33 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LINC01545Q5VT33 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LINC01545Q5VT33 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LINC01545Q5VT33 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LINC01545Q5VT33 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
LINC01545Q5VT33 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LINC01545Q5VT33 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
LINC01545Q5VT33 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LINC01545Q5VT33 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LINC01545Q5VT33 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LINC01545Q5VT33 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LINC01545Q5VT33 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LINC01545Q5VT33 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LINC01545Q5VT33 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms