Protein–RNA interactions for Protein: Q5T890

ERCC6L2, DNA excision repair protein ERCC-6-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6L2Q5T890 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.97■■■■■ 4.79
ERCC6L2Q5T890 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC44.95■■■■■ 4.79
ERCC6L2Q5T890 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.95■■■■■ 4.79
ERCC6L2Q5T890 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC44.92■■■■■ 4.78
ERCC6L2Q5T890 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC44.91■■■■■ 4.78
ERCC6L2Q5T890 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.89■■■■■ 4.78
ERCC6L2Q5T890 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC44.88■■■■■ 4.78
ERCC6L2Q5T890 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.88■■■■■ 4.78
ERCC6L2Q5T890 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC44.87■■■■■ 4.77
ERCC6L2Q5T890 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC44.86■■■■■ 4.77
ERCC6L2Q5T890 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.85■■■■■ 4.77
ERCC6L2Q5T890 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC44.83■■■■■ 4.77
ERCC6L2Q5T890 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.82■■■■■ 4.76
ERCC6L2Q5T890 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.82■■■■■ 4.76
ERCC6L2Q5T890 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC44.8■■■■■ 4.76
ERCC6L2Q5T890 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.78■■■■■ 4.76
ERCC6L2Q5T890 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.78■■■■■ 4.76
ERCC6L2Q5T890 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC44.72■■■■■ 4.75
ERCC6L2Q5T890 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC44.7■■■■■ 4.75
ERCC6L2Q5T890 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC44.69■■■■■ 4.75
ERCC6L2Q5T890 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.69■■■■■ 4.75
ERCC6L2Q5T890 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.68■■■■■ 4.74
ERCC6L2Q5T890 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC44.67■■■■■ 4.74
ERCC6L2Q5T890 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.67■■■■■ 4.74
ERCC6L2Q5T890 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC44.66■■■■■ 4.74
ERCC6L2Q5T890 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC44.65■■■■■ 4.74
ERCC6L2Q5T890 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC44.65■■■■■ 4.74
ERCC6L2Q5T890 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC44.64■■■■■ 4.74
ERCC6L2Q5T890 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
ERCC6L2Q5T890 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC44.64■■■■■ 4.74
ERCC6L2Q5T890 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC44.64■■■■■ 4.74
ERCC6L2Q5T890 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC44.64■■■■■ 4.74
ERCC6L2Q5T890 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC44.64■■■■■ 4.74
ERCC6L2Q5T890 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.62■■■■■ 4.73
ERCC6L2Q5T890 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC44.62■■■■■ 4.73
ERCC6L2Q5T890 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC44.61■■■■■ 4.73
ERCC6L2Q5T890 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC44.61■■■■■ 4.73
ERCC6L2Q5T890 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC44.61■■■■■ 4.73
ERCC6L2Q5T890 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC44.59■■■■■ 4.73
ERCC6L2Q5T890 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC44.59■■■■■ 4.73
ERCC6L2Q5T890 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC44.58■■■■■ 4.73
ERCC6L2Q5T890 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC44.57■■■■■ 4.73
ERCC6L2Q5T890 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.56■■■■■ 4.72
ERCC6L2Q5T890 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.54■■■■■ 4.72
ERCC6L2Q5T890 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
ERCC6L2Q5T890 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC44.52■■■■■ 4.72
ERCC6L2Q5T890 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.49■■■■■ 4.71
ERCC6L2Q5T890 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.49■■■■■ 4.71
ERCC6L2Q5T890 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.49■■■■■ 4.71
ERCC6L2Q5T890 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.49■■■■■ 4.71
ERCC6L2Q5T890 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC44.48■■■■■ 4.71
ERCC6L2Q5T890 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.46■■■■■ 4.71
ERCC6L2Q5T890 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.44■■■■■ 4.71
ERCC6L2Q5T890 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC44.43■■■■■ 4.7
ERCC6L2Q5T890 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC44.42■■■■■ 4.7
ERCC6L2Q5T890 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC44.42■■■■■ 4.7
ERCC6L2Q5T890 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.4■■■■■ 4.7
ERCC6L2Q5T890 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
ERCC6L2Q5T890 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
ERCC6L2Q5T890 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC44.35■■■■■ 4.69
ERCC6L2Q5T890 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.35■■■■■ 4.69
ERCC6L2Q5T890 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC44.35■■■■■ 4.69
ERCC6L2Q5T890 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC44.35■■■■■ 4.69
ERCC6L2Q5T890 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
ERCC6L2Q5T890 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC44.31■■■■■ 4.68
ERCC6L2Q5T890 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.31■■■■■ 4.68
ERCC6L2Q5T890 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC44.28■■■■■ 4.68
ERCC6L2Q5T890 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.28■■■■■ 4.68
ERCC6L2Q5T890 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
ERCC6L2Q5T890 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
ERCC6L2Q5T890 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.26■■■■■ 4.68
ERCC6L2Q5T890 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC44.26■■■■■ 4.68
ERCC6L2Q5T890 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.26■■■■■ 4.68
ERCC6L2Q5T890 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
ERCC6L2Q5T890 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC44.25■■■■■ 4.67
ERCC6L2Q5T890 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC44.25■■■■■ 4.67
ERCC6L2Q5T890 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC44.25■■■■■ 4.67
ERCC6L2Q5T890 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
ERCC6L2Q5T890 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
ERCC6L2Q5T890 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
ERCC6L2Q5T890 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC44.19■■■■■ 4.66
ERCC6L2Q5T890 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC44.19■■■■■ 4.66
ERCC6L2Q5T890 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC44.18■■■■■ 4.66
ERCC6L2Q5T890 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.17■■■■■ 4.66
ERCC6L2Q5T890 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC44.17■■■■■ 4.66
ERCC6L2Q5T890 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.14■■■■■ 4.66
ERCC6L2Q5T890 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC44.14■■■■■ 4.66
ERCC6L2Q5T890 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC44.14■■■■■ 4.66
ERCC6L2Q5T890 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC44.14■■■■■ 4.66
ERCC6L2Q5T890 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC44.13■■■■■ 4.65
ERCC6L2Q5T890 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC44.13■■■■■ 4.65
ERCC6L2Q5T890 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.1■■■■■ 4.65
ERCC6L2Q5T890 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC44.1■■■■■ 4.65
ERCC6L2Q5T890 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC44.09■■■■■ 4.65
ERCC6L2Q5T890 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC44.07■■■■■ 4.65
ERCC6L2Q5T890 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.07■■■■■ 4.65
ERCC6L2Q5T890 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
ERCC6L2Q5T890 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
ERCC6L2Q5T890 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC44.06■■■■■ 4.64
ERCC6L2Q5T890 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.05■■■■■ 4.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms