Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNT2

TMEM201, Transmembrane protein 201, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM201Q5SNT2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM201Q5SNT2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM201Q5SNT2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM201Q5SNT2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM201Q5SNT2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM201Q5SNT2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM201Q5SNT2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TMEM201Q5SNT2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TMEM201Q5SNT2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TMEM201Q5SNT2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM201Q5SNT2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM201Q5SNT2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM201Q5SNT2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM201Q5SNT2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM201Q5SNT2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM201Q5SNT2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM201Q5SNT2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM201Q5SNT2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM201Q5SNT2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM201Q5SNT2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM201Q5SNT2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM201Q5SNT2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMEM201Q5SNT2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM201Q5SNT2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM201Q5SNT2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM201Q5SNT2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM201Q5SNT2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM201Q5SNT2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM201Q5SNT2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM201Q5SNT2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM201Q5SNT2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM201Q5SNT2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM201Q5SNT2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM201Q5SNT2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM201Q5SNT2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM201Q5SNT2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM201Q5SNT2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM201Q5SNT2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM201Q5SNT2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM201Q5SNT2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM201Q5SNT2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM201Q5SNT2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM201Q5SNT2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM201Q5SNT2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM201Q5SNT2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM201Q5SNT2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM201Q5SNT2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM201Q5SNT2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM201Q5SNT2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM201Q5SNT2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM201Q5SNT2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM201Q5SNT2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM201Q5SNT2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM201Q5SNT2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM201Q5SNT2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM201Q5SNT2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM201Q5SNT2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM201Q5SNT2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM201Q5SNT2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM201Q5SNT2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM201Q5SNT2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM201Q5SNT2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM201Q5SNT2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM201Q5SNT2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM201Q5SNT2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM201Q5SNT2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM201Q5SNT2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM201Q5SNT2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM201Q5SNT2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM201Q5SNT2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM201Q5SNT2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMEM201Q5SNT2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM201Q5SNT2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM201Q5SNT2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM201Q5SNT2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM201Q5SNT2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM201Q5SNT2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM201Q5SNT2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM201Q5SNT2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM201Q5SNT2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM201Q5SNT2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM201Q5SNT2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM201Q5SNT2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM201Q5SNT2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM201Q5SNT2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM201Q5SNT2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM201Q5SNT2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TMEM201Q5SNT2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TMEM201Q5SNT2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM201Q5SNT2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM201Q5SNT2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM201Q5SNT2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM201Q5SNT2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM201Q5SNT2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM201Q5SNT2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM201Q5SNT2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM201Q5SNT2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM201Q5SNT2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM201Q5SNT2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM201Q5SNT2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms