Protein–RNA interactions for Protein: Q5JXB2

UBE2NL, Putative ubiquitin-conjugating enzyme E2 N-like, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NLQ5JXB2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE2NLQ5JXB2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBE2NLQ5JXB2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE2NLQ5JXB2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE2NLQ5JXB2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE2NLQ5JXB2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBE2NLQ5JXB2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBE2NLQ5JXB2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE2NLQ5JXB2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE2NLQ5JXB2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE2NLQ5JXB2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE2NLQ5JXB2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE2NLQ5JXB2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE2NLQ5JXB2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE2NLQ5JXB2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE2NLQ5JXB2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
UBE2NLQ5JXB2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
UBE2NLQ5JXB2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
UBE2NLQ5JXB2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
UBE2NLQ5JXB2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE2NLQ5JXB2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE2NLQ5JXB2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE2NLQ5JXB2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE2NLQ5JXB2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE2NLQ5JXB2 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE2NLQ5JXB2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE2NLQ5JXB2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE2NLQ5JXB2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE2NLQ5JXB2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE2NLQ5JXB2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE2NLQ5JXB2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
UBE2NLQ5JXB2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
UBE2NLQ5JXB2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE2NLQ5JXB2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE2NLQ5JXB2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE2NLQ5JXB2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE2NLQ5JXB2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE2NLQ5JXB2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE2NLQ5JXB2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE2NLQ5JXB2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE2NLQ5JXB2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE2NLQ5JXB2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE2NLQ5JXB2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE2NLQ5JXB2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE2NLQ5JXB2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE2NLQ5JXB2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE2NLQ5JXB2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE2NLQ5JXB2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE2NLQ5JXB2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBE2NLQ5JXB2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE2NLQ5JXB2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE2NLQ5JXB2 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE2NLQ5JXB2 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE2NLQ5JXB2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE2NLQ5JXB2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE2NLQ5JXB2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE2NLQ5JXB2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE2NLQ5JXB2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE2NLQ5JXB2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE2NLQ5JXB2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE2NLQ5JXB2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE2NLQ5JXB2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE2NLQ5JXB2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE2NLQ5JXB2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE2NLQ5JXB2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE2NLQ5JXB2 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE2NLQ5JXB2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE2NLQ5JXB2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE2NLQ5JXB2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE2NLQ5JXB2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE2NLQ5JXB2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE2NLQ5JXB2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE2NLQ5JXB2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE2NLQ5JXB2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE2NLQ5JXB2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE2NLQ5JXB2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE2NLQ5JXB2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE2NLQ5JXB2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE2NLQ5JXB2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE2NLQ5JXB2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE2NLQ5JXB2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE2NLQ5JXB2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE2NLQ5JXB2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE2NLQ5JXB2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE2NLQ5JXB2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE2NLQ5JXB2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE2NLQ5JXB2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE2NLQ5JXB2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE2NLQ5JXB2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE2NLQ5JXB2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE2NLQ5JXB2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE2NLQ5JXB2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE2NLQ5JXB2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE2NLQ5JXB2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UBE2NLQ5JXB2 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBE2NLQ5JXB2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE2NLQ5JXB2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE2NLQ5JXB2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE2NLQ5JXB2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE2NLQ5JXB2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms