Protein–RNA interactions for Protein: Q53T94

TAF1B, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1BQ53T94 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TAF1BQ53T94 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TAF1BQ53T94 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TAF1BQ53T94 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TAF1BQ53T94 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TAF1BQ53T94 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TAF1BQ53T94 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TAF1BQ53T94 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TAF1BQ53T94 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TAF1BQ53T94 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TAF1BQ53T94 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TAF1BQ53T94 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
TAF1BQ53T94 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TAF1BQ53T94 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TAF1BQ53T94 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TAF1BQ53T94 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TAF1BQ53T94 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TAF1BQ53T94 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TAF1BQ53T94 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TAF1BQ53T94 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TAF1BQ53T94 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TAF1BQ53T94 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TAF1BQ53T94 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TAF1BQ53T94 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TAF1BQ53T94 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TAF1BQ53T94 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TAF1BQ53T94 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TAF1BQ53T94 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TAF1BQ53T94 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TAF1BQ53T94 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TAF1BQ53T94 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
TAF1BQ53T94 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TAF1BQ53T94 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TAF1BQ53T94 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TAF1BQ53T94 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TAF1BQ53T94 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TAF1BQ53T94 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TAF1BQ53T94 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TAF1BQ53T94 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TAF1BQ53T94 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TAF1BQ53T94 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TAF1BQ53T94 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TAF1BQ53T94 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TAF1BQ53T94 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TAF1BQ53T94 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TAF1BQ53T94 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TAF1BQ53T94 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
TAF1BQ53T94 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TAF1BQ53T94 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TAF1BQ53T94 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TAF1BQ53T94 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TAF1BQ53T94 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TAF1BQ53T94 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TAF1BQ53T94 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TAF1BQ53T94 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TAF1BQ53T94 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TAF1BQ53T94 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TAF1BQ53T94 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TAF1BQ53T94 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TAF1BQ53T94 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TAF1BQ53T94 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TAF1BQ53T94 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TAF1BQ53T94 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TAF1BQ53T94 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TAF1BQ53T94 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TAF1BQ53T94 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TAF1BQ53T94 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TAF1BQ53T94 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TAF1BQ53T94 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TAF1BQ53T94 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TAF1BQ53T94 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TAF1BQ53T94 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TAF1BQ53T94 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TAF1BQ53T94 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TAF1BQ53T94 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TAF1BQ53T94 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TAF1BQ53T94 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TAF1BQ53T94 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TAF1BQ53T94 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TAF1BQ53T94 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TAF1BQ53T94 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TAF1BQ53T94 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TAF1BQ53T94 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TAF1BQ53T94 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TAF1BQ53T94 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TAF1BQ53T94 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TAF1BQ53T94 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TAF1BQ53T94 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TAF1BQ53T94 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TAF1BQ53T94 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TAF1BQ53T94 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TAF1BQ53T94 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TAF1BQ53T94 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TAF1BQ53T94 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TAF1BQ53T94 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TAF1BQ53T94 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TAF1BQ53T94 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TAF1BQ53T94 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TAF1BQ53T94 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TAF1BQ53T94 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms