Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRTAP21-3Q3LHN1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRTAP21-3Q3LHN1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRTAP21-3Q3LHN1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRTAP21-3Q3LHN1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KRTAP21-3Q3LHN1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRTAP21-3Q3LHN1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRTAP21-3Q3LHN1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRTAP21-3Q3LHN1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRTAP21-3Q3LHN1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRTAP21-3Q3LHN1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRTAP21-3Q3LHN1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRTAP21-3Q3LHN1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRTAP21-3Q3LHN1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRTAP21-3Q3LHN1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRTAP21-3Q3LHN1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRTAP21-3Q3LHN1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRTAP21-3Q3LHN1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRTAP21-3Q3LHN1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRTAP21-3Q3LHN1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRTAP21-3Q3LHN1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRTAP21-3Q3LHN1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRTAP21-3Q3LHN1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRTAP21-3Q3LHN1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRTAP21-3Q3LHN1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRTAP21-3Q3LHN1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRTAP21-3Q3LHN1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRTAP21-3Q3LHN1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRTAP21-3Q3LHN1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRTAP21-3Q3LHN1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KRTAP21-3Q3LHN1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRTAP21-3Q3LHN1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRTAP21-3Q3LHN1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRTAP21-3Q3LHN1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRTAP21-3Q3LHN1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRTAP21-3Q3LHN1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRTAP21-3Q3LHN1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KRTAP21-3Q3LHN1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KRTAP21-3Q3LHN1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRTAP21-3Q3LHN1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KRTAP21-3Q3LHN1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRTAP21-3Q3LHN1 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRTAP21-3Q3LHN1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRTAP21-3Q3LHN1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRTAP21-3Q3LHN1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRTAP21-3Q3LHN1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRTAP21-3Q3LHN1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRTAP21-3Q3LHN1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRTAP21-3Q3LHN1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRTAP21-3Q3LHN1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRTAP21-3Q3LHN1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KRTAP21-3Q3LHN1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KRTAP21-3Q3LHN1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KRTAP21-3Q3LHN1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRTAP21-3Q3LHN1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRTAP21-3Q3LHN1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KRTAP21-3Q3LHN1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRTAP21-3Q3LHN1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRTAP21-3Q3LHN1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KRTAP21-3Q3LHN1 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRTAP21-3Q3LHN1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRTAP21-3Q3LHN1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRTAP21-3Q3LHN1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KRTAP21-3Q3LHN1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRTAP21-3Q3LHN1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KRTAP21-3Q3LHN1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRTAP21-3Q3LHN1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRTAP21-3Q3LHN1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRTAP21-3Q3LHN1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRTAP21-3Q3LHN1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRTAP21-3Q3LHN1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRTAP21-3Q3LHN1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRTAP21-3Q3LHN1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRTAP21-3Q3LHN1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRTAP21-3Q3LHN1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRTAP21-3Q3LHN1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRTAP21-3Q3LHN1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRTAP21-3Q3LHN1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRTAP21-3Q3LHN1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRTAP21-3Q3LHN1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRTAP21-3Q3LHN1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRTAP21-3Q3LHN1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRTAP21-3Q3LHN1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRTAP21-3Q3LHN1 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRTAP21-3Q3LHN1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRTAP21-3Q3LHN1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KRTAP21-3Q3LHN1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRTAP21-3Q3LHN1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRTAP21-3Q3LHN1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRTAP21-3Q3LHN1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KRTAP21-3Q3LHN1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRTAP21-3Q3LHN1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRTAP21-3Q3LHN1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRTAP21-3Q3LHN1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRTAP21-3Q3LHN1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRTAP21-3Q3LHN1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRTAP21-3Q3LHN1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98 ms