Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q1T7F1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q1T7F1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q1T7F1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q1T7F1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Q1T7F1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q1T7F1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q1T7F1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q1T7F1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q1T7F1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q1T7F1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q1T7F1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q1T7F1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q1T7F1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q1T7F1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q1T7F1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q1T7F1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q1T7F1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q1T7F1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q1T7F1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q1T7F1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q1T7F1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q1T7F1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q1T7F1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Q1T7F1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q1T7F1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q1T7F1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q1T7F1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q1T7F1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q1T7F1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q1T7F1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q1T7F1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q1T7F1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q1T7F1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q1T7F1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q1T7F1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q1T7F1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q1T7F1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q1T7F1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q1T7F1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q1T7F1 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Q1T7F1 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q1T7F1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q1T7F1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q1T7F1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q1T7F1 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q1T7F1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q1T7F1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q1T7F1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q1T7F1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q1T7F1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q1T7F1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q1T7F1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q1T7F1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q1T7F1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q1T7F1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q1T7F1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q1T7F1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q1T7F1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q1T7F1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q1T7F1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q1T7F1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q1T7F1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q1T7F1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q1T7F1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q1T7F1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q1T7F1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q1T7F1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q1T7F1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q1T7F1 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q1T7F1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q1T7F1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q1T7F1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q1T7F1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q1T7F1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q1T7F1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q1T7F1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q1T7F1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q1T7F1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q1T7F1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q1T7F1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q1T7F1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q1T7F1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q1T7F1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q1T7F1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q1T7F1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q1T7F1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q1T7F1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q1T7F1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q1T7F1 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q1T7F1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q1T7F1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q1T7F1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q1T7F1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q1T7F1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q1T7F1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q1T7F1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q1T7F1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q1T7F1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q1T7F1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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