Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PDK4Q16654 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDK4Q16654 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDK4Q16654 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDK4Q16654 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDK4Q16654 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDK4Q16654 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDK4Q16654 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDK4Q16654 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDK4Q16654 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PDK4Q16654 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDK4Q16654 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDK4Q16654 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDK4Q16654 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDK4Q16654 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDK4Q16654 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDK4Q16654 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PDK4Q16654 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDK4Q16654 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PDK4Q16654 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDK4Q16654 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDK4Q16654 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDK4Q16654 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDK4Q16654 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDK4Q16654 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDK4Q16654 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDK4Q16654 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDK4Q16654 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDK4Q16654 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDK4Q16654 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDK4Q16654 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDK4Q16654 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDK4Q16654 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDK4Q16654 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDK4Q16654 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDK4Q16654 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
PDK4Q16654 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PDK4Q16654 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDK4Q16654 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDK4Q16654 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDK4Q16654 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDK4Q16654 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDK4Q16654 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PDK4Q16654 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDK4Q16654 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDK4Q16654 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDK4Q16654 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDK4Q16654 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDK4Q16654 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDK4Q16654 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PDK4Q16654 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PDK4Q16654 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDK4Q16654 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDK4Q16654 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDK4Q16654 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDK4Q16654 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDK4Q16654 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDK4Q16654 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PDK4Q16654 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDK4Q16654 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDK4Q16654 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDK4Q16654 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDK4Q16654 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDK4Q16654 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDK4Q16654 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDK4Q16654 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDK4Q16654 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDK4Q16654 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDK4Q16654 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
PDK4Q16654 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDK4Q16654 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDK4Q16654 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDK4Q16654 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDK4Q16654 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDK4Q16654 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDK4Q16654 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDK4Q16654 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDK4Q16654 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDK4Q16654 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDK4Q16654 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDK4Q16654 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDK4Q16654 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDK4Q16654 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDK4Q16654 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDK4Q16654 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDK4Q16654 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDK4Q16654 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDK4Q16654 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDK4Q16654 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDK4Q16654 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDK4Q16654 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDK4Q16654 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDK4Q16654 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDK4Q16654 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDK4Q16654 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDK4Q16654 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDK4Q16654 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDK4Q16654 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDK4Q16654 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDK4Q16654 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
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